Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpusd4Q9CWX4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpusd4Q9CWX4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpusd4Q9CWX4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpusd4Q9CWX4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpusd4Q9CWX4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpusd4Q9CWX4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpusd4Q9CWX4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpusd4Q9CWX4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpusd4Q9CWX4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpusd4Q9CWX4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpusd4Q9CWX4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpusd4Q9CWX4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpusd4Q9CWX4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpusd4Q9CWX4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpusd4Q9CWX4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpusd4Q9CWX4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpusd4Q9CWX4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpusd4Q9CWX4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpusd4Q9CWX4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpusd4Q9CWX4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpusd4Q9CWX4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpusd4Q9CWX4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpusd4Q9CWX4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpusd4Q9CWX4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpusd4Q9CWX4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpusd4Q9CWX4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpusd4Q9CWX4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpusd4Q9CWX4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpusd4Q9CWX4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpusd4Q9CWX4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpusd4Q9CWX4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpusd4Q9CWX4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpusd4Q9CWX4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpusd4Q9CWX4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpusd4Q9CWX4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpusd4Q9CWX4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpusd4Q9CWX4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpusd4Q9CWX4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpusd4Q9CWX4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpusd4Q9CWX4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpusd4Q9CWX4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpusd4Q9CWX4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpusd4Q9CWX4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpusd4Q9CWX4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpusd4Q9CWX4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpusd4Q9CWX4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpusd4Q9CWX4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rpusd4Q9CWX4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms