Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWJ3

Katnbl1, KATNB1-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnbl1Q9CWJ3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Katnbl1Q9CWJ3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Katnbl1Q9CWJ3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Katnbl1Q9CWJ3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Katnbl1Q9CWJ3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Katnbl1Q9CWJ3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Katnbl1Q9CWJ3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Katnbl1Q9CWJ3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Katnbl1Q9CWJ3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Katnbl1Q9CWJ3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Katnbl1Q9CWJ3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Katnbl1Q9CWJ3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Katnbl1Q9CWJ3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Katnbl1Q9CWJ3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Katnbl1Q9CWJ3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Katnbl1Q9CWJ3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Katnbl1Q9CWJ3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Katnbl1Q9CWJ3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Katnbl1Q9CWJ3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Katnbl1Q9CWJ3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Katnbl1Q9CWJ3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Katnbl1Q9CWJ3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Katnbl1Q9CWJ3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Katnbl1Q9CWJ3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Katnbl1Q9CWJ3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Katnbl1Q9CWJ3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Katnbl1Q9CWJ3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Katnbl1Q9CWJ3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Katnbl1Q9CWJ3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Katnbl1Q9CWJ3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Katnbl1Q9CWJ3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Katnbl1Q9CWJ3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Katnbl1Q9CWJ3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Katnbl1Q9CWJ3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Katnbl1Q9CWJ3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Katnbl1Q9CWJ3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Katnbl1Q9CWJ3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Katnbl1Q9CWJ3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Katnbl1Q9CWJ3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Katnbl1Q9CWJ3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Katnbl1Q9CWJ3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Katnbl1Q9CWJ3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Katnbl1Q9CWJ3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Katnbl1Q9CWJ3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Katnbl1Q9CWJ3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Katnbl1Q9CWJ3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Katnbl1Q9CWJ3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Katnbl1Q9CWJ3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Katnbl1Q9CWJ3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Katnbl1Q9CWJ3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Katnbl1Q9CWJ3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Katnbl1Q9CWJ3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Katnbl1Q9CWJ3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Katnbl1Q9CWJ3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Katnbl1Q9CWJ3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Katnbl1Q9CWJ3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Katnbl1Q9CWJ3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Katnbl1Q9CWJ3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Katnbl1Q9CWJ3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Katnbl1Q9CWJ3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Katnbl1Q9CWJ3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Katnbl1Q9CWJ3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Katnbl1Q9CWJ3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Katnbl1Q9CWJ3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Katnbl1Q9CWJ3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Katnbl1Q9CWJ3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Katnbl1Q9CWJ3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Katnbl1Q9CWJ3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Katnbl1Q9CWJ3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Katnbl1Q9CWJ3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Katnbl1Q9CWJ3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Katnbl1Q9CWJ3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Katnbl1Q9CWJ3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Katnbl1Q9CWJ3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Katnbl1Q9CWJ3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Katnbl1Q9CWJ3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Katnbl1Q9CWJ3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Katnbl1Q9CWJ3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Katnbl1Q9CWJ3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Katnbl1Q9CWJ3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Katnbl1Q9CWJ3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Katnbl1Q9CWJ3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Katnbl1Q9CWJ3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Katnbl1Q9CWJ3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Katnbl1Q9CWJ3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Katnbl1Q9CWJ3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Katnbl1Q9CWJ3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Katnbl1Q9CWJ3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Katnbl1Q9CWJ3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Katnbl1Q9CWJ3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Katnbl1Q9CWJ3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Katnbl1Q9CWJ3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Katnbl1Q9CWJ3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Katnbl1Q9CWJ3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Katnbl1Q9CWJ3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Katnbl1Q9CWJ3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Katnbl1Q9CWJ3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Katnbl1Q9CWJ3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Katnbl1Q9CWJ3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Katnbl1Q9CWJ3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms