Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NubplQ9CWD8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NubplQ9CWD8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NubplQ9CWD8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NubplQ9CWD8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NubplQ9CWD8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NubplQ9CWD8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NubplQ9CWD8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NubplQ9CWD8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NubplQ9CWD8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NubplQ9CWD8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NubplQ9CWD8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NubplQ9CWD8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NubplQ9CWD8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NubplQ9CWD8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NubplQ9CWD8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NubplQ9CWD8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NubplQ9CWD8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NubplQ9CWD8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NubplQ9CWD8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NubplQ9CWD8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NubplQ9CWD8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NubplQ9CWD8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NubplQ9CWD8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NubplQ9CWD8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NubplQ9CWD8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NubplQ9CWD8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NubplQ9CWD8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NubplQ9CWD8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NubplQ9CWD8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NubplQ9CWD8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NubplQ9CWD8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NubplQ9CWD8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NubplQ9CWD8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NubplQ9CWD8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NubplQ9CWD8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NubplQ9CWD8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NubplQ9CWD8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NubplQ9CWD8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NubplQ9CWD8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NubplQ9CWD8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NubplQ9CWD8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NubplQ9CWD8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NubplQ9CWD8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NubplQ9CWD8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NubplQ9CWD8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NubplQ9CWD8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NubplQ9CWD8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NubplQ9CWD8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NubplQ9CWD8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NubplQ9CWD8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NubplQ9CWD8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NubplQ9CWD8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NubplQ9CWD8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NubplQ9CWD8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NubplQ9CWD8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NubplQ9CWD8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NubplQ9CWD8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NubplQ9CWD8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NubplQ9CWD8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NubplQ9CWD8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NubplQ9CWD8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NubplQ9CWD8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NubplQ9CWD8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NubplQ9CWD8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NubplQ9CWD8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NubplQ9CWD8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NubplQ9CWD8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NubplQ9CWD8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NubplQ9CWD8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NubplQ9CWD8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NubplQ9CWD8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NubplQ9CWD8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NubplQ9CWD8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NubplQ9CWD8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NubplQ9CWD8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NubplQ9CWD8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NubplQ9CWD8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NubplQ9CWD8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NubplQ9CWD8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NubplQ9CWD8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NubplQ9CWD8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NubplQ9CWD8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NubplQ9CWD8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NubplQ9CWD8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NubplQ9CWD8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NubplQ9CWD8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NubplQ9CWD8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NubplQ9CWD8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NubplQ9CWD8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NubplQ9CWD8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NubplQ9CWD8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NubplQ9CWD8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NubplQ9CWD8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NubplQ9CWD8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NubplQ9CWD8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NubplQ9CWD8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NubplQ9CWD8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NubplQ9CWD8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NubplQ9CWD8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms