Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUS9

Sppl3, Signal peptide peptidase-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl3Q9CUS9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sppl3Q9CUS9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sppl3Q9CUS9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sppl3Q9CUS9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sppl3Q9CUS9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sppl3Q9CUS9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sppl3Q9CUS9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sppl3Q9CUS9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sppl3Q9CUS9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sppl3Q9CUS9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sppl3Q9CUS9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sppl3Q9CUS9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sppl3Q9CUS9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sppl3Q9CUS9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sppl3Q9CUS9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sppl3Q9CUS9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sppl3Q9CUS9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sppl3Q9CUS9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sppl3Q9CUS9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sppl3Q9CUS9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sppl3Q9CUS9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sppl3Q9CUS9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sppl3Q9CUS9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sppl3Q9CUS9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sppl3Q9CUS9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sppl3Q9CUS9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sppl3Q9CUS9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sppl3Q9CUS9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Sppl3Q9CUS9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sppl3Q9CUS9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sppl3Q9CUS9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Sppl3Q9CUS9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sppl3Q9CUS9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sppl3Q9CUS9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sppl3Q9CUS9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sppl3Q9CUS9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sppl3Q9CUS9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sppl3Q9CUS9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sppl3Q9CUS9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sppl3Q9CUS9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sppl3Q9CUS9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sppl3Q9CUS9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sppl3Q9CUS9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sppl3Q9CUS9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sppl3Q9CUS9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sppl3Q9CUS9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Sppl3Q9CUS9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sppl3Q9CUS9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sppl3Q9CUS9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sppl3Q9CUS9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sppl3Q9CUS9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sppl3Q9CUS9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sppl3Q9CUS9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sppl3Q9CUS9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sppl3Q9CUS9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sppl3Q9CUS9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sppl3Q9CUS9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sppl3Q9CUS9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sppl3Q9CUS9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sppl3Q9CUS9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Sppl3Q9CUS9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sppl3Q9CUS9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sppl3Q9CUS9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sppl3Q9CUS9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sppl3Q9CUS9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sppl3Q9CUS9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sppl3Q9CUS9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sppl3Q9CUS9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sppl3Q9CUS9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sppl3Q9CUS9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sppl3Q9CUS9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sppl3Q9CUS9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sppl3Q9CUS9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sppl3Q9CUS9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sppl3Q9CUS9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sppl3Q9CUS9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sppl3Q9CUS9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sppl3Q9CUS9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sppl3Q9CUS9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sppl3Q9CUS9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sppl3Q9CUS9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sppl3Q9CUS9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sppl3Q9CUS9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Sppl3Q9CUS9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sppl3Q9CUS9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sppl3Q9CUS9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sppl3Q9CUS9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sppl3Q9CUS9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sppl3Q9CUS9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sppl3Q9CUS9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sppl3Q9CUS9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sppl3Q9CUS9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sppl3Q9CUS9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sppl3Q9CUS9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sppl3Q9CUS9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sppl3Q9CUS9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sppl3Q9CUS9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sppl3Q9CUS9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sppl3Q9CUS9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sppl3Q9CUS9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms