Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rhobtb3Q9CTN4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rhobtb3Q9CTN4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Rhobtb3Q9CTN4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rhobtb3Q9CTN4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rhobtb3Q9CTN4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rhobtb3Q9CTN4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rhobtb3Q9CTN4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rhobtb3Q9CTN4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rhobtb3Q9CTN4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rhobtb3Q9CTN4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rhobtb3Q9CTN4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rhobtb3Q9CTN4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rhobtb3Q9CTN4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rhobtb3Q9CTN4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rhobtb3Q9CTN4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rhobtb3Q9CTN4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rhobtb3Q9CTN4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rhobtb3Q9CTN4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rhobtb3Q9CTN4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Rhobtb3Q9CTN4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rhobtb3Q9CTN4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rhobtb3Q9CTN4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rhobtb3Q9CTN4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rhobtb3Q9CTN4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rhobtb3Q9CTN4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rhobtb3Q9CTN4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rhobtb3Q9CTN4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rhobtb3Q9CTN4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rhobtb3Q9CTN4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rhobtb3Q9CTN4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rhobtb3Q9CTN4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rhobtb3Q9CTN4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rhobtb3Q9CTN4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rhobtb3Q9CTN4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rhobtb3Q9CTN4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rhobtb3Q9CTN4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rhobtb3Q9CTN4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rhobtb3Q9CTN4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rhobtb3Q9CTN4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rhobtb3Q9CTN4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rhobtb3Q9CTN4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rhobtb3Q9CTN4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rhobtb3Q9CTN4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rhobtb3Q9CTN4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rhobtb3Q9CTN4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rhobtb3Q9CTN4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rhobtb3Q9CTN4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rhobtb3Q9CTN4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rhobtb3Q9CTN4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rhobtb3Q9CTN4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rhobtb3Q9CTN4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rhobtb3Q9CTN4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rhobtb3Q9CTN4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rhobtb3Q9CTN4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rhobtb3Q9CTN4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rhobtb3Q9CTN4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rhobtb3Q9CTN4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rhobtb3Q9CTN4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rhobtb3Q9CTN4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rhobtb3Q9CTN4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rhobtb3Q9CTN4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rhobtb3Q9CTN4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rhobtb3Q9CTN4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rhobtb3Q9CTN4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rhobtb3Q9CTN4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rhobtb3Q9CTN4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rhobtb3Q9CTN4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rhobtb3Q9CTN4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rhobtb3Q9CTN4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rhobtb3Q9CTN4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rhobtb3Q9CTN4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rhobtb3Q9CTN4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rhobtb3Q9CTN4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rhobtb3Q9CTN4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rhobtb3Q9CTN4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rhobtb3Q9CTN4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rhobtb3Q9CTN4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rhobtb3Q9CTN4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Rhobtb3Q9CTN4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rhobtb3Q9CTN4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rhobtb3Q9CTN4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rhobtb3Q9CTN4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rhobtb3Q9CTN4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rhobtb3Q9CTN4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rhobtb3Q9CTN4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rhobtb3Q9CTN4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rhobtb3Q9CTN4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rhobtb3Q9CTN4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rhobtb3Q9CTN4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rhobtb3Q9CTN4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rhobtb3Q9CTN4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rhobtb3Q9CTN4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms