Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rprd1bQ9CSU0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rprd1bQ9CSU0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rprd1bQ9CSU0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rprd1bQ9CSU0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rprd1bQ9CSU0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rprd1bQ9CSU0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rprd1bQ9CSU0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rprd1bQ9CSU0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rprd1bQ9CSU0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rprd1bQ9CSU0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rprd1bQ9CSU0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rprd1bQ9CSU0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rprd1bQ9CSU0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rprd1bQ9CSU0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rprd1bQ9CSU0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rprd1bQ9CSU0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rprd1bQ9CSU0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rprd1bQ9CSU0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rprd1bQ9CSU0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rprd1bQ9CSU0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rprd1bQ9CSU0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rprd1bQ9CSU0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rprd1bQ9CSU0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rprd1bQ9CSU0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rprd1bQ9CSU0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rprd1bQ9CSU0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rprd1bQ9CSU0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rprd1bQ9CSU0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rprd1bQ9CSU0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rprd1bQ9CSU0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rprd1bQ9CSU0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rprd1bQ9CSU0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rprd1bQ9CSU0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rprd1bQ9CSU0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rprd1bQ9CSU0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rprd1bQ9CSU0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rprd1bQ9CSU0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rprd1bQ9CSU0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rprd1bQ9CSU0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rprd1bQ9CSU0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rprd1bQ9CSU0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rprd1bQ9CSU0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rprd1bQ9CSU0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rprd1bQ9CSU0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rprd1bQ9CSU0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rprd1bQ9CSU0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rprd1bQ9CSU0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rprd1bQ9CSU0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rprd1bQ9CSU0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rprd1bQ9CSU0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rprd1bQ9CSU0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rprd1bQ9CSU0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rprd1bQ9CSU0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rprd1bQ9CSU0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rprd1bQ9CSU0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rprd1bQ9CSU0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rprd1bQ9CSU0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rprd1bQ9CSU0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rprd1bQ9CSU0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rprd1bQ9CSU0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rprd1bQ9CSU0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rprd1bQ9CSU0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rprd1bQ9CSU0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rprd1bQ9CSU0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rprd1bQ9CSU0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rprd1bQ9CSU0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rprd1bQ9CSU0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rprd1bQ9CSU0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rprd1bQ9CSU0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rprd1bQ9CSU0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rprd1bQ9CSU0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rprd1bQ9CSU0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rprd1bQ9CSU0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rprd1bQ9CSU0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rprd1bQ9CSU0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rprd1bQ9CSU0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rprd1bQ9CSU0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rprd1bQ9CSU0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rprd1bQ9CSU0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rprd1bQ9CSU0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rprd1bQ9CSU0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rprd1bQ9CSU0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rprd1bQ9CSU0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rprd1bQ9CSU0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rprd1bQ9CSU0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rprd1bQ9CSU0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rprd1bQ9CSU0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rprd1bQ9CSU0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rprd1bQ9CSU0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms