Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klhl28Q9CR40 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klhl28Q9CR40 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klhl28Q9CR40 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klhl28Q9CR40 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klhl28Q9CR40 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klhl28Q9CR40 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klhl28Q9CR40 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klhl28Q9CR40 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klhl28Q9CR40 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Klhl28Q9CR40 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Klhl28Q9CR40 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Klhl28Q9CR40 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Klhl28Q9CR40 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Klhl28Q9CR40 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Klhl28Q9CR40 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Klhl28Q9CR40 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Klhl28Q9CR40 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Klhl28Q9CR40 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Klhl28Q9CR40 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Klhl28Q9CR40 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Klhl28Q9CR40 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Klhl28Q9CR40 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Klhl28Q9CR40 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klhl28Q9CR40 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klhl28Q9CR40 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klhl28Q9CR40 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klhl28Q9CR40 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klhl28Q9CR40 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klhl28Q9CR40 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klhl28Q9CR40 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klhl28Q9CR40 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klhl28Q9CR40 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klhl28Q9CR40 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klhl28Q9CR40 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klhl28Q9CR40 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klhl28Q9CR40 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klhl28Q9CR40 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klhl28Q9CR40 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klhl28Q9CR40 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klhl28Q9CR40 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klhl28Q9CR40 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klhl28Q9CR40 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klhl28Q9CR40 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klhl28Q9CR40 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klhl28Q9CR40 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klhl28Q9CR40 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klhl28Q9CR40 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Klhl28Q9CR40 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klhl28Q9CR40 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klhl28Q9CR40 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klhl28Q9CR40 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klhl28Q9CR40 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klhl28Q9CR40 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klhl28Q9CR40 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klhl28Q9CR40 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klhl28Q9CR40 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klhl28Q9CR40 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klhl28Q9CR40 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klhl28Q9CR40 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klhl28Q9CR40 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klhl28Q9CR40 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klhl28Q9CR40 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klhl28Q9CR40 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klhl28Q9CR40 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klhl28Q9CR40 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klhl28Q9CR40 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klhl28Q9CR40 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klhl28Q9CR40 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klhl28Q9CR40 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klhl28Q9CR40 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klhl28Q9CR40 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klhl28Q9CR40 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klhl28Q9CR40 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klhl28Q9CR40 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klhl28Q9CR40 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klhl28Q9CR40 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klhl28Q9CR40 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klhl28Q9CR40 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klhl28Q9CR40 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klhl28Q9CR40 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klhl28Q9CR40 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klhl28Q9CR40 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klhl28Q9CR40 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klhl28Q9CR40 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Klhl28Q9CR40 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klhl28Q9CR40 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klhl28Q9CR40 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klhl28Q9CR40 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhl28Q9CR40 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhl28Q9CR40 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhl28Q9CR40 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhl28Q9CR40 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhl28Q9CR40 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhl28Q9CR40 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhl28Q9CR40 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhl28Q9CR40 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhl28Q9CR40 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhl28Q9CR40 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhl28Q9CR40 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms