Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR29

Ccdc43, Coiled-coil domain-containing protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc43Q9CR29 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc43Q9CR29 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc43Q9CR29 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc43Q9CR29 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc43Q9CR29 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc43Q9CR29 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ccdc43Q9CR29 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc43Q9CR29 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc43Q9CR29 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc43Q9CR29 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc43Q9CR29 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc43Q9CR29 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc43Q9CR29 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc43Q9CR29 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc43Q9CR29 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc43Q9CR29 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc43Q9CR29 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc43Q9CR29 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc43Q9CR29 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc43Q9CR29 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc43Q9CR29 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc43Q9CR29 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc43Q9CR29 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc43Q9CR29 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc43Q9CR29 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc43Q9CR29 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc43Q9CR29 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc43Q9CR29 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc43Q9CR29 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc43Q9CR29 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc43Q9CR29 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc43Q9CR29 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc43Q9CR29 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc43Q9CR29 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc43Q9CR29 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc43Q9CR29 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc43Q9CR29 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc43Q9CR29 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc43Q9CR29 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc43Q9CR29 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc43Q9CR29 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc43Q9CR29 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc43Q9CR29 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc43Q9CR29 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc43Q9CR29 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc43Q9CR29 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc43Q9CR29 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc43Q9CR29 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc43Q9CR29 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc43Q9CR29 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc43Q9CR29 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc43Q9CR29 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc43Q9CR29 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc43Q9CR29 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc43Q9CR29 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc43Q9CR29 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc43Q9CR29 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc43Q9CR29 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc43Q9CR29 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc43Q9CR29 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc43Q9CR29 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc43Q9CR29 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc43Q9CR29 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc43Q9CR29 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc43Q9CR29 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc43Q9CR29 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc43Q9CR29 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc43Q9CR29 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc43Q9CR29 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc43Q9CR29 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc43Q9CR29 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc43Q9CR29 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc43Q9CR29 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc43Q9CR29 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc43Q9CR29 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc43Q9CR29 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc43Q9CR29 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc43Q9CR29 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc43Q9CR29 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc43Q9CR29 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc43Q9CR29 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc43Q9CR29 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc43Q9CR29 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc43Q9CR29 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc43Q9CR29 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc43Q9CR29 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc43Q9CR29 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc43Q9CR29 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc43Q9CR29 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc43Q9CR29 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc43Q9CR29 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc43Q9CR29 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc43Q9CR29 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc43Q9CR29 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc43Q9CR29 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc43Q9CR29 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc43Q9CR29 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc43Q9CR29 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc43Q9CR29 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc43Q9CR29 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms