Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ykt6Q9CQW1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ykt6Q9CQW1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ykt6Q9CQW1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ykt6Q9CQW1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ykt6Q9CQW1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ykt6Q9CQW1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ykt6Q9CQW1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ykt6Q9CQW1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ykt6Q9CQW1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ykt6Q9CQW1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ykt6Q9CQW1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ykt6Q9CQW1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ykt6Q9CQW1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ykt6Q9CQW1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ykt6Q9CQW1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ykt6Q9CQW1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ykt6Q9CQW1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ykt6Q9CQW1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ykt6Q9CQW1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ykt6Q9CQW1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ykt6Q9CQW1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ykt6Q9CQW1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ykt6Q9CQW1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ykt6Q9CQW1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ykt6Q9CQW1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ykt6Q9CQW1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ykt6Q9CQW1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ykt6Q9CQW1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ykt6Q9CQW1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ykt6Q9CQW1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ykt6Q9CQW1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ykt6Q9CQW1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ykt6Q9CQW1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ykt6Q9CQW1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ykt6Q9CQW1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ykt6Q9CQW1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ykt6Q9CQW1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ykt6Q9CQW1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ykt6Q9CQW1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ykt6Q9CQW1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ykt6Q9CQW1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ykt6Q9CQW1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ykt6Q9CQW1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ykt6Q9CQW1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ykt6Q9CQW1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ykt6Q9CQW1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ykt6Q9CQW1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ykt6Q9CQW1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ykt6Q9CQW1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ykt6Q9CQW1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ykt6Q9CQW1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ykt6Q9CQW1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ykt6Q9CQW1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ykt6Q9CQW1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ykt6Q9CQW1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ykt6Q9CQW1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ykt6Q9CQW1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ykt6Q9CQW1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ykt6Q9CQW1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ykt6Q9CQW1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ykt6Q9CQW1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ykt6Q9CQW1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ykt6Q9CQW1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ykt6Q9CQW1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ykt6Q9CQW1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ykt6Q9CQW1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ykt6Q9CQW1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ykt6Q9CQW1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ykt6Q9CQW1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ykt6Q9CQW1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ykt6Q9CQW1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ykt6Q9CQW1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ykt6Q9CQW1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ykt6Q9CQW1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ykt6Q9CQW1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ykt6Q9CQW1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ykt6Q9CQW1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ykt6Q9CQW1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ykt6Q9CQW1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ykt6Q9CQW1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ykt6Q9CQW1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ykt6Q9CQW1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ykt6Q9CQW1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ykt6Q9CQW1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ykt6Q9CQW1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ykt6Q9CQW1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ykt6Q9CQW1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ykt6Q9CQW1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ykt6Q9CQW1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ykt6Q9CQW1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ykt6Q9CQW1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ykt6Q9CQW1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ykt6Q9CQW1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ykt6Q9CQW1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ykt6Q9CQW1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ykt6Q9CQW1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ykt6Q9CQW1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ykt6Q9CQW1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ykt6Q9CQW1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms