Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS8

Sec61b, Protein transport protein Sec61 subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 96 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec61bQ9CQS8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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