Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK7

Rwdd1, RWD domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd1Q9CQK7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rwdd1Q9CQK7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Rwdd1Q9CQK7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rwdd1Q9CQK7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rwdd1Q9CQK7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rwdd1Q9CQK7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rwdd1Q9CQK7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rwdd1Q9CQK7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rwdd1Q9CQK7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rwdd1Q9CQK7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rwdd1Q9CQK7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rwdd1Q9CQK7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rwdd1Q9CQK7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Rwdd1Q9CQK7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rwdd1Q9CQK7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rwdd1Q9CQK7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rwdd1Q9CQK7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Rwdd1Q9CQK7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rwdd1Q9CQK7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rwdd1Q9CQK7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rwdd1Q9CQK7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rwdd1Q9CQK7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Rwdd1Q9CQK7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rwdd1Q9CQK7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rwdd1Q9CQK7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rwdd1Q9CQK7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rwdd1Q9CQK7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rwdd1Q9CQK7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rwdd1Q9CQK7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rwdd1Q9CQK7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rwdd1Q9CQK7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rwdd1Q9CQK7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rwdd1Q9CQK7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rwdd1Q9CQK7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rwdd1Q9CQK7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rwdd1Q9CQK7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rwdd1Q9CQK7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rwdd1Q9CQK7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rwdd1Q9CQK7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rwdd1Q9CQK7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rwdd1Q9CQK7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rwdd1Q9CQK7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rwdd1Q9CQK7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rwdd1Q9CQK7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rwdd1Q9CQK7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rwdd1Q9CQK7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rwdd1Q9CQK7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rwdd1Q9CQK7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rwdd1Q9CQK7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rwdd1Q9CQK7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rwdd1Q9CQK7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rwdd1Q9CQK7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rwdd1Q9CQK7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rwdd1Q9CQK7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rwdd1Q9CQK7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rwdd1Q9CQK7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rwdd1Q9CQK7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rwdd1Q9CQK7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rwdd1Q9CQK7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rwdd1Q9CQK7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Rwdd1Q9CQK7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rwdd1Q9CQK7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rwdd1Q9CQK7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rwdd1Q9CQK7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Rwdd1Q9CQK7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rwdd1Q9CQK7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Rwdd1Q9CQK7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rwdd1Q9CQK7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rwdd1Q9CQK7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rwdd1Q9CQK7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rwdd1Q9CQK7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rwdd1Q9CQK7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rwdd1Q9CQK7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rwdd1Q9CQK7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rwdd1Q9CQK7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Rwdd1Q9CQK7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rwdd1Q9CQK7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rwdd1Q9CQK7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rwdd1Q9CQK7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rwdd1Q9CQK7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rwdd1Q9CQK7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rwdd1Q9CQK7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rwdd1Q9CQK7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Rwdd1Q9CQK7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rwdd1Q9CQK7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rwdd1Q9CQK7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rwdd1Q9CQK7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Rwdd1Q9CQK7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rwdd1Q9CQK7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rwdd1Q9CQK7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rwdd1Q9CQK7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rwdd1Q9CQK7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rwdd1Q9CQK7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rwdd1Q9CQK7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rwdd1Q9CQK7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Rwdd1Q9CQK7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rwdd1Q9CQK7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rwdd1Q9CQK7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Rwdd1Q9CQK7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rwdd1Q9CQK7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms