Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ndufb9Q9CQJ8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ndufb9Q9CQJ8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ndufb9Q9CQJ8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ndufb9Q9CQJ8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ndufb9Q9CQJ8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ndufb9Q9CQJ8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ndufb9Q9CQJ8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ndufb9Q9CQJ8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ndufb9Q9CQJ8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ndufb9Q9CQJ8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ndufb9Q9CQJ8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ndufb9Q9CQJ8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ndufb9Q9CQJ8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ndufb9Q9CQJ8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ndufb9Q9CQJ8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ndufb9Q9CQJ8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ndufb9Q9CQJ8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ndufb9Q9CQJ8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ndufb9Q9CQJ8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ndufb9Q9CQJ8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ndufb9Q9CQJ8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ndufb9Q9CQJ8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ndufb9Q9CQJ8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ndufb9Q9CQJ8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ndufb9Q9CQJ8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ndufb9Q9CQJ8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ndufb9Q9CQJ8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ndufb9Q9CQJ8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ndufb9Q9CQJ8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ndufb9Q9CQJ8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ndufb9Q9CQJ8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ndufb9Q9CQJ8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ndufb9Q9CQJ8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ndufb9Q9CQJ8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ndufb9Q9CQJ8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ndufb9Q9CQJ8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ndufb9Q9CQJ8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ndufb9Q9CQJ8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ndufb9Q9CQJ8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ndufb9Q9CQJ8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ndufb9Q9CQJ8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ndufb9Q9CQJ8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ndufb9Q9CQJ8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ndufb9Q9CQJ8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ndufb9Q9CQJ8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ndufb9Q9CQJ8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ndufb9Q9CQJ8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ndufb9Q9CQJ8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ndufb9Q9CQJ8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ndufb9Q9CQJ8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ndufb9Q9CQJ8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ndufb9Q9CQJ8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ndufb9Q9CQJ8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ndufb9Q9CQJ8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ndufb9Q9CQJ8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ndufb9Q9CQJ8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ndufb9Q9CQJ8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ndufb9Q9CQJ8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ndufb9Q9CQJ8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ndufb9Q9CQJ8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ndufb9Q9CQJ8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ndufb9Q9CQJ8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ndufb9Q9CQJ8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ndufb9Q9CQJ8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ndufb9Q9CQJ8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ndufb9Q9CQJ8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ndufb9Q9CQJ8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ndufb9Q9CQJ8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ndufb9Q9CQJ8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ndufb9Q9CQJ8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ndufb9Q9CQJ8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ndufb9Q9CQJ8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ndufb9Q9CQJ8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ndufb9Q9CQJ8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ndufb9Q9CQJ8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ndufb9Q9CQJ8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ndufb9Q9CQJ8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ndufb9Q9CQJ8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ndufb9Q9CQJ8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ndufb9Q9CQJ8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ndufb9Q9CQJ8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ndufb9Q9CQJ8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ndufb9Q9CQJ8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ndufb9Q9CQJ8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ndufb9Q9CQJ8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ndufb9Q9CQJ8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ndufb9Q9CQJ8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ndufb9Q9CQJ8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ndufb9Q9CQJ8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ndufb9Q9CQJ8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms