Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nudt21Q9CQF3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nudt21Q9CQF3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nudt21Q9CQF3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nudt21Q9CQF3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nudt21Q9CQF3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nudt21Q9CQF3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nudt21Q9CQF3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nudt21Q9CQF3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Nudt21Q9CQF3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nudt21Q9CQF3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nudt21Q9CQF3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nudt21Q9CQF3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nudt21Q9CQF3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nudt21Q9CQF3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nudt21Q9CQF3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Nudt21Q9CQF3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nudt21Q9CQF3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nudt21Q9CQF3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nudt21Q9CQF3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nudt21Q9CQF3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nudt21Q9CQF3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nudt21Q9CQF3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nudt21Q9CQF3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nudt21Q9CQF3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nudt21Q9CQF3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nudt21Q9CQF3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nudt21Q9CQF3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nudt21Q9CQF3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nudt21Q9CQF3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nudt21Q9CQF3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Nudt21Q9CQF3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nudt21Q9CQF3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nudt21Q9CQF3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Nudt21Q9CQF3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nudt21Q9CQF3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nudt21Q9CQF3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nudt21Q9CQF3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nudt21Q9CQF3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nudt21Q9CQF3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nudt21Q9CQF3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nudt21Q9CQF3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nudt21Q9CQF3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Nudt21Q9CQF3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nudt21Q9CQF3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nudt21Q9CQF3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Nudt21Q9CQF3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Nudt21Q9CQF3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nudt21Q9CQF3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nudt21Q9CQF3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nudt21Q9CQF3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Nudt21Q9CQF3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nudt21Q9CQF3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nudt21Q9CQF3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nudt21Q9CQF3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nudt21Q9CQF3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nudt21Q9CQF3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nudt21Q9CQF3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nudt21Q9CQF3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nudt21Q9CQF3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nudt21Q9CQF3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nudt21Q9CQF3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nudt21Q9CQF3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nudt21Q9CQF3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nudt21Q9CQF3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nudt21Q9CQF3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nudt21Q9CQF3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nudt21Q9CQF3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nudt21Q9CQF3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Nudt21Q9CQF3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nudt21Q9CQF3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nudt21Q9CQF3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nudt21Q9CQF3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nudt21Q9CQF3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Nudt21Q9CQF3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Nudt21Q9CQF3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nudt21Q9CQF3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nudt21Q9CQF3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nudt21Q9CQF3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nudt21Q9CQF3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nudt21Q9CQF3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nudt21Q9CQF3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nudt21Q9CQF3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nudt21Q9CQF3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nudt21Q9CQF3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nudt21Q9CQF3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nudt21Q9CQF3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nudt21Q9CQF3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nudt21Q9CQF3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nudt21Q9CQF3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nudt21Q9CQF3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nudt21Q9CQF3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nudt21Q9CQF3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nudt21Q9CQF3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Nudt21Q9CQF3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nudt21Q9CQF3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Nudt21Q9CQF3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nudt21Q9CQF3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nudt21Q9CQF3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nudt21Q9CQF3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms