Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF0

Mrpl11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl11Q9CQF0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mrpl11Q9CQF0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mrpl11Q9CQF0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mrpl11Q9CQF0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Mrpl11Q9CQF0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mrpl11Q9CQF0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mrpl11Q9CQF0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mrpl11Q9CQF0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mrpl11Q9CQF0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mrpl11Q9CQF0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mrpl11Q9CQF0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mrpl11Q9CQF0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mrpl11Q9CQF0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mrpl11Q9CQF0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mrpl11Q9CQF0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mrpl11Q9CQF0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mrpl11Q9CQF0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mrpl11Q9CQF0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mrpl11Q9CQF0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mrpl11Q9CQF0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mrpl11Q9CQF0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mrpl11Q9CQF0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mrpl11Q9CQF0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mrpl11Q9CQF0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mrpl11Q9CQF0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mrpl11Q9CQF0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mrpl11Q9CQF0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Mrpl11Q9CQF0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mrpl11Q9CQF0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mrpl11Q9CQF0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mrpl11Q9CQF0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Mrpl11Q9CQF0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mrpl11Q9CQF0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mrpl11Q9CQF0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mrpl11Q9CQF0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mrpl11Q9CQF0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mrpl11Q9CQF0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mrpl11Q9CQF0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Mrpl11Q9CQF0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mrpl11Q9CQF0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mrpl11Q9CQF0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Mrpl11Q9CQF0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mrpl11Q9CQF0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mrpl11Q9CQF0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mrpl11Q9CQF0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mrpl11Q9CQF0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mrpl11Q9CQF0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Mrpl11Q9CQF0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Mrpl11Q9CQF0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mrpl11Q9CQF0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mrpl11Q9CQF0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mrpl11Q9CQF0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mrpl11Q9CQF0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mrpl11Q9CQF0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mrpl11Q9CQF0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mrpl11Q9CQF0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mrpl11Q9CQF0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mrpl11Q9CQF0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mrpl11Q9CQF0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mrpl11Q9CQF0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mrpl11Q9CQF0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mrpl11Q9CQF0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mrpl11Q9CQF0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mrpl11Q9CQF0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mrpl11Q9CQF0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mrpl11Q9CQF0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mrpl11Q9CQF0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mrpl11Q9CQF0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Mrpl11Q9CQF0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Mrpl11Q9CQF0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mrpl11Q9CQF0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Mrpl11Q9CQF0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mrpl11Q9CQF0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mrpl11Q9CQF0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mrpl11Q9CQF0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mrpl11Q9CQF0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mrpl11Q9CQF0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mrpl11Q9CQF0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mrpl11Q9CQF0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mrpl11Q9CQF0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mrpl11Q9CQF0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mrpl11Q9CQF0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Mrpl11Q9CQF0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mrpl11Q9CQF0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mrpl11Q9CQF0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mrpl11Q9CQF0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mrpl11Q9CQF0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mrpl11Q9CQF0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mrpl11Q9CQF0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mrpl11Q9CQF0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mrpl11Q9CQF0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mrpl11Q9CQF0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mrpl11Q9CQF0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mrpl11Q9CQF0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mrpl11Q9CQF0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mrpl11Q9CQF0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mrpl11Q9CQF0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mrpl11Q9CQF0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mrpl11Q9CQF0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mrpl11Q9CQF0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms