Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE6

Asf1a, Histone chaperone ASF1A, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asf1aQ9CQE6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Asf1aQ9CQE6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Asf1aQ9CQE6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Asf1aQ9CQE6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Asf1aQ9CQE6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Asf1aQ9CQE6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Asf1aQ9CQE6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Asf1aQ9CQE6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Asf1aQ9CQE6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Asf1aQ9CQE6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Asf1aQ9CQE6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Asf1aQ9CQE6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Asf1aQ9CQE6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Asf1aQ9CQE6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Asf1aQ9CQE6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Asf1aQ9CQE6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Asf1aQ9CQE6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Asf1aQ9CQE6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Asf1aQ9CQE6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Asf1aQ9CQE6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Asf1aQ9CQE6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Asf1aQ9CQE6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Asf1aQ9CQE6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Asf1aQ9CQE6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Asf1aQ9CQE6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Asf1aQ9CQE6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Asf1aQ9CQE6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Asf1aQ9CQE6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Asf1aQ9CQE6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Asf1aQ9CQE6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Asf1aQ9CQE6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Asf1aQ9CQE6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Asf1aQ9CQE6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Asf1aQ9CQE6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Asf1aQ9CQE6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Asf1aQ9CQE6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Asf1aQ9CQE6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Asf1aQ9CQE6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Asf1aQ9CQE6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Asf1aQ9CQE6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Asf1aQ9CQE6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Asf1aQ9CQE6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Asf1aQ9CQE6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Asf1aQ9CQE6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Asf1aQ9CQE6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Asf1aQ9CQE6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Asf1aQ9CQE6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Asf1aQ9CQE6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Asf1aQ9CQE6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Asf1aQ9CQE6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Asf1aQ9CQE6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Asf1aQ9CQE6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Asf1aQ9CQE6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Asf1aQ9CQE6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Asf1aQ9CQE6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Asf1aQ9CQE6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Asf1aQ9CQE6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Asf1aQ9CQE6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Asf1aQ9CQE6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Asf1aQ9CQE6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Asf1aQ9CQE6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Asf1aQ9CQE6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Asf1aQ9CQE6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Asf1aQ9CQE6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Asf1aQ9CQE6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Asf1aQ9CQE6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Asf1aQ9CQE6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Asf1aQ9CQE6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Asf1aQ9CQE6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Asf1aQ9CQE6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Asf1aQ9CQE6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Asf1aQ9CQE6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Asf1aQ9CQE6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Asf1aQ9CQE6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Asf1aQ9CQE6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Asf1aQ9CQE6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Asf1aQ9CQE6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Asf1aQ9CQE6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Asf1aQ9CQE6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Asf1aQ9CQE6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Asf1aQ9CQE6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Asf1aQ9CQE6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Asf1aQ9CQE6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Asf1aQ9CQE6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Asf1aQ9CQE6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Asf1aQ9CQE6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Asf1aQ9CQE6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Asf1aQ9CQE6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Asf1aQ9CQE6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Asf1aQ9CQE6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Asf1aQ9CQE6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Asf1aQ9CQE6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Asf1aQ9CQE6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Asf1aQ9CQE6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Asf1aQ9CQE6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Asf1aQ9CQE6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Asf1aQ9CQE6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Asf1aQ9CQE6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Asf1aQ9CQE6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Asf1aQ9CQE6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms