Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nipsnap3bQ9CQE1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nipsnap3bQ9CQE1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nipsnap3bQ9CQE1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nipsnap3bQ9CQE1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nipsnap3bQ9CQE1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nipsnap3bQ9CQE1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nipsnap3bQ9CQE1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nipsnap3bQ9CQE1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nipsnap3bQ9CQE1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nipsnap3bQ9CQE1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nipsnap3bQ9CQE1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nipsnap3bQ9CQE1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nipsnap3bQ9CQE1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nipsnap3bQ9CQE1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nipsnap3bQ9CQE1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nipsnap3bQ9CQE1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nipsnap3bQ9CQE1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nipsnap3bQ9CQE1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nipsnap3bQ9CQE1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nipsnap3bQ9CQE1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nipsnap3bQ9CQE1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nipsnap3bQ9CQE1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nipsnap3bQ9CQE1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nipsnap3bQ9CQE1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nipsnap3bQ9CQE1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nipsnap3bQ9CQE1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nipsnap3bQ9CQE1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nipsnap3bQ9CQE1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nipsnap3bQ9CQE1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nipsnap3bQ9CQE1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nipsnap3bQ9CQE1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Nipsnap3bQ9CQE1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nipsnap3bQ9CQE1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nipsnap3bQ9CQE1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nipsnap3bQ9CQE1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nipsnap3bQ9CQE1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nipsnap3bQ9CQE1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nipsnap3bQ9CQE1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nipsnap3bQ9CQE1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nipsnap3bQ9CQE1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.7
Nipsnap3bQ9CQE1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nipsnap3bQ9CQE1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nipsnap3bQ9CQE1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nipsnap3bQ9CQE1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Nipsnap3bQ9CQE1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nipsnap3bQ9CQE1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nipsnap3bQ9CQE1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nipsnap3bQ9CQE1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nipsnap3bQ9CQE1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nipsnap3bQ9CQE1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nipsnap3bQ9CQE1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nipsnap3bQ9CQE1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nipsnap3bQ9CQE1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nipsnap3bQ9CQE1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nipsnap3bQ9CQE1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nipsnap3bQ9CQE1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nipsnap3bQ9CQE1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nipsnap3bQ9CQE1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nipsnap3bQ9CQE1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nipsnap3bQ9CQE1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nipsnap3bQ9CQE1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nipsnap3bQ9CQE1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nipsnap3bQ9CQE1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nipsnap3bQ9CQE1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nipsnap3bQ9CQE1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nipsnap3bQ9CQE1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nipsnap3bQ9CQE1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Nipsnap3bQ9CQE1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nipsnap3bQ9CQE1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nipsnap3bQ9CQE1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nipsnap3bQ9CQE1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nipsnap3bQ9CQE1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nipsnap3bQ9CQE1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nipsnap3bQ9CQE1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nipsnap3bQ9CQE1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nipsnap3bQ9CQE1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nipsnap3bQ9CQE1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nipsnap3bQ9CQE1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nipsnap3bQ9CQE1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nipsnap3bQ9CQE1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nipsnap3bQ9CQE1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Nipsnap3bQ9CQE1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms