Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA5

Med4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med4Q9CQA5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Med4Q9CQA5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Med4Q9CQA5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Med4Q9CQA5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Med4Q9CQA5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Med4Q9CQA5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Med4Q9CQA5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Med4Q9CQA5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Med4Q9CQA5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Med4Q9CQA5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Med4Q9CQA5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Med4Q9CQA5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Med4Q9CQA5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Med4Q9CQA5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Med4Q9CQA5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Med4Q9CQA5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Med4Q9CQA5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Med4Q9CQA5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Med4Q9CQA5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Med4Q9CQA5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Med4Q9CQA5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Med4Q9CQA5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Med4Q9CQA5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Med4Q9CQA5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Med4Q9CQA5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Med4Q9CQA5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Med4Q9CQA5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Med4Q9CQA5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Med4Q9CQA5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Med4Q9CQA5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Med4Q9CQA5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Med4Q9CQA5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Med4Q9CQA5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Med4Q9CQA5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Med4Q9CQA5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Med4Q9CQA5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Med4Q9CQA5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Med4Q9CQA5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Med4Q9CQA5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Med4Q9CQA5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Med4Q9CQA5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Med4Q9CQA5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Med4Q9CQA5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Med4Q9CQA5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Med4Q9CQA5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Med4Q9CQA5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Med4Q9CQA5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Med4Q9CQA5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Med4Q9CQA5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Med4Q9CQA5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Med4Q9CQA5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Med4Q9CQA5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Med4Q9CQA5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Med4Q9CQA5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Med4Q9CQA5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Med4Q9CQA5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Med4Q9CQA5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Med4Q9CQA5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Med4Q9CQA5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Med4Q9CQA5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Med4Q9CQA5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Med4Q9CQA5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Med4Q9CQA5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Med4Q9CQA5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Med4Q9CQA5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Med4Q9CQA5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Med4Q9CQA5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Med4Q9CQA5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Med4Q9CQA5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Med4Q9CQA5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Med4Q9CQA5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Med4Q9CQA5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Med4Q9CQA5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Med4Q9CQA5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Med4Q9CQA5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Med4Q9CQA5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Med4Q9CQA5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Med4Q9CQA5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Med4Q9CQA5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Med4Q9CQA5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Med4Q9CQA5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Med4Q9CQA5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Med4Q9CQA5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Med4Q9CQA5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Med4Q9CQA5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Med4Q9CQA5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Med4Q9CQA5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Med4Q9CQA5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Med4Q9CQA5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Med4Q9CQA5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Med4Q9CQA5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Med4Q9CQA5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Med4Q9CQA5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Med4Q9CQA5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Med4Q9CQA5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Med4Q9CQA5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Med4Q9CQA5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Med4Q9CQA5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Med4Q9CQA5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Med4Q9CQA5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms