Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ40

Mrpl49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl49Q9CQ40 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl49Q9CQ40 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl49Q9CQ40 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl49Q9CQ40 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrpl49Q9CQ40 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrpl49Q9CQ40 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrpl49Q9CQ40 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrpl49Q9CQ40 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrpl49Q9CQ40 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrpl49Q9CQ40 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrpl49Q9CQ40 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl49Q9CQ40 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl49Q9CQ40 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl49Q9CQ40 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl49Q9CQ40 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl49Q9CQ40 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl49Q9CQ40 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl49Q9CQ40 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl49Q9CQ40 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl49Q9CQ40 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl49Q9CQ40 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl49Q9CQ40 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl49Q9CQ40 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl49Q9CQ40 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl49Q9CQ40 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl49Q9CQ40 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl49Q9CQ40 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl49Q9CQ40 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl49Q9CQ40 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl49Q9CQ40 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl49Q9CQ40 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl49Q9CQ40 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl49Q9CQ40 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl49Q9CQ40 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl49Q9CQ40 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl49Q9CQ40 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl49Q9CQ40 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl49Q9CQ40 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl49Q9CQ40 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl49Q9CQ40 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl49Q9CQ40 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl49Q9CQ40 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl49Q9CQ40 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl49Q9CQ40 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl49Q9CQ40 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl49Q9CQ40 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl49Q9CQ40 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl49Q9CQ40 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl49Q9CQ40 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl49Q9CQ40 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl49Q9CQ40 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl49Q9CQ40 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl49Q9CQ40 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl49Q9CQ40 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl49Q9CQ40 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl49Q9CQ40 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl49Q9CQ40 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl49Q9CQ40 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl49Q9CQ40 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl49Q9CQ40 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl49Q9CQ40 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl49Q9CQ40 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl49Q9CQ40 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl49Q9CQ40 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl49Q9CQ40 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl49Q9CQ40 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl49Q9CQ40 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl49Q9CQ40 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl49Q9CQ40 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl49Q9CQ40 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl49Q9CQ40 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl49Q9CQ40 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl49Q9CQ40 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl49Q9CQ40 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl49Q9CQ40 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mrpl49Q9CQ40 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mrpl49Q9CQ40 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mrpl49Q9CQ40 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Mrpl49Q9CQ40 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mrpl49Q9CQ40 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mrpl49Q9CQ40 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Mrpl49Q9CQ40 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Mrpl49Q9CQ40 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mrpl49Q9CQ40 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mrpl49Q9CQ40 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mrpl49Q9CQ40 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mrpl49Q9CQ40 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mrpl49Q9CQ40 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mrpl49Q9CQ40 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mrpl49Q9CQ40 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mrpl49Q9CQ40 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mrpl49Q9CQ40 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mrpl49Q9CQ40 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mrpl49Q9CQ40 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mrpl49Q9CQ40 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mrpl49Q9CQ40 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mrpl49Q9CQ40 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mrpl49Q9CQ40 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mrpl49Q9CQ40 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mrpl49Q9CQ40 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms