Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chmp3Q9CQ10 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Chmp3Q9CQ10 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chmp3Q9CQ10 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chmp3Q9CQ10 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chmp3Q9CQ10 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chmp3Q9CQ10 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chmp3Q9CQ10 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chmp3Q9CQ10 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chmp3Q9CQ10 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chmp3Q9CQ10 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chmp3Q9CQ10 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chmp3Q9CQ10 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chmp3Q9CQ10 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chmp3Q9CQ10 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chmp3Q9CQ10 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chmp3Q9CQ10 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chmp3Q9CQ10 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chmp3Q9CQ10 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Chmp3Q9CQ10 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chmp3Q9CQ10 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chmp3Q9CQ10 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chmp3Q9CQ10 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chmp3Q9CQ10 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chmp3Q9CQ10 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chmp3Q9CQ10 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chmp3Q9CQ10 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chmp3Q9CQ10 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chmp3Q9CQ10 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chmp3Q9CQ10 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chmp3Q9CQ10 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chmp3Q9CQ10 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chmp3Q9CQ10 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chmp3Q9CQ10 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Chmp3Q9CQ10 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chmp3Q9CQ10 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chmp3Q9CQ10 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chmp3Q9CQ10 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chmp3Q9CQ10 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chmp3Q9CQ10 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chmp3Q9CQ10 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chmp3Q9CQ10 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chmp3Q9CQ10 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chmp3Q9CQ10 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Chmp3Q9CQ10 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Chmp3Q9CQ10 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Chmp3Q9CQ10 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Chmp3Q9CQ10 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Chmp3Q9CQ10 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Chmp3Q9CQ10 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Chmp3Q9CQ10 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chmp3Q9CQ10 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chmp3Q9CQ10 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chmp3Q9CQ10 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chmp3Q9CQ10 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chmp3Q9CQ10 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chmp3Q9CQ10 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chmp3Q9CQ10 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chmp3Q9CQ10 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chmp3Q9CQ10 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chmp3Q9CQ10 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chmp3Q9CQ10 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chmp3Q9CQ10 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chmp3Q9CQ10 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Chmp3Q9CQ10 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chmp3Q9CQ10 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chmp3Q9CQ10 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Chmp3Q9CQ10 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chmp3Q9CQ10 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chmp3Q9CQ10 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chmp3Q9CQ10 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chmp3Q9CQ10 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chmp3Q9CQ10 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Chmp3Q9CQ10 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chmp3Q9CQ10 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chmp3Q9CQ10 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chmp3Q9CQ10 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chmp3Q9CQ10 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chmp3Q9CQ10 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chmp3Q9CQ10 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chmp3Q9CQ10 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chmp3Q9CQ10 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Chmp3Q9CQ10 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chmp3Q9CQ10 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chmp3Q9CQ10 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chmp3Q9CQ10 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chmp3Q9CQ10 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chmp3Q9CQ10 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chmp3Q9CQ10 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chmp3Q9CQ10 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chmp3Q9CQ10 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chmp3Q9CQ10 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chmp3Q9CQ10 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chmp3Q9CQ10 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chmp3Q9CQ10 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Chmp3Q9CQ10 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Chmp3Q9CQ10 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chmp3Q9CQ10 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chmp3Q9CQ10 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chmp3Q9CQ10 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
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