Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPZ1

Ccdc198, Uncharacterized protein CCDC198, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc198Q9CPZ1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc198Q9CPZ1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc198Q9CPZ1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc198Q9CPZ1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc198Q9CPZ1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc198Q9CPZ1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc198Q9CPZ1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc198Q9CPZ1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc198Q9CPZ1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc198Q9CPZ1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc198Q9CPZ1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc198Q9CPZ1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc198Q9CPZ1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc198Q9CPZ1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc198Q9CPZ1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc198Q9CPZ1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc198Q9CPZ1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc198Q9CPZ1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc198Q9CPZ1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc198Q9CPZ1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc198Q9CPZ1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc198Q9CPZ1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc198Q9CPZ1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc198Q9CPZ1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc198Q9CPZ1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc198Q9CPZ1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc198Q9CPZ1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc198Q9CPZ1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc198Q9CPZ1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc198Q9CPZ1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc198Q9CPZ1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc198Q9CPZ1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc198Q9CPZ1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc198Q9CPZ1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc198Q9CPZ1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc198Q9CPZ1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc198Q9CPZ1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms