Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPP0

Npm3, Nucleoplasmin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm3Q9CPP0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Npm3Q9CPP0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Npm3Q9CPP0 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Npm3Q9CPP0 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Npm3Q9CPP0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Npm3Q9CPP0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Npm3Q9CPP0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Npm3Q9CPP0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Npm3Q9CPP0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Npm3Q9CPP0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Npm3Q9CPP0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Npm3Q9CPP0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Npm3Q9CPP0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Npm3Q9CPP0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Npm3Q9CPP0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Npm3Q9CPP0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Npm3Q9CPP0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Npm3Q9CPP0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Npm3Q9CPP0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Npm3Q9CPP0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Npm3Q9CPP0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Npm3Q9CPP0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Npm3Q9CPP0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Npm3Q9CPP0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Npm3Q9CPP0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Npm3Q9CPP0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Npm3Q9CPP0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Npm3Q9CPP0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Npm3Q9CPP0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Npm3Q9CPP0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Npm3Q9CPP0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Npm3Q9CPP0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Npm3Q9CPP0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Npm3Q9CPP0 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Npm3Q9CPP0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Npm3Q9CPP0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Npm3Q9CPP0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Npm3Q9CPP0 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Npm3Q9CPP0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Npm3Q9CPP0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Npm3Q9CPP0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Npm3Q9CPP0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Npm3Q9CPP0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Npm3Q9CPP0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Npm3Q9CPP0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Npm3Q9CPP0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Npm3Q9CPP0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Npm3Q9CPP0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Npm3Q9CPP0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Npm3Q9CPP0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Npm3Q9CPP0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Npm3Q9CPP0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Npm3Q9CPP0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Npm3Q9CPP0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Npm3Q9CPP0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Npm3Q9CPP0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Npm3Q9CPP0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Npm3Q9CPP0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Npm3Q9CPP0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Npm3Q9CPP0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Npm3Q9CPP0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Npm3Q9CPP0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Npm3Q9CPP0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Npm3Q9CPP0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Npm3Q9CPP0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Npm3Q9CPP0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Npm3Q9CPP0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Npm3Q9CPP0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Npm3Q9CPP0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Npm3Q9CPP0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Npm3Q9CPP0 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Npm3Q9CPP0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Npm3Q9CPP0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Npm3Q9CPP0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Npm3Q9CPP0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Npm3Q9CPP0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Npm3Q9CPP0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Npm3Q9CPP0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Npm3Q9CPP0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Npm3Q9CPP0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Npm3Q9CPP0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Npm3Q9CPP0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Npm3Q9CPP0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Npm3Q9CPP0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Npm3Q9CPP0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Npm3Q9CPP0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Npm3Q9CPP0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Npm3Q9CPP0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Npm3Q9CPP0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Npm3Q9CPP0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Npm3Q9CPP0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Npm3Q9CPP0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Npm3Q9CPP0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Npm3Q9CPP0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Npm3Q9CPP0 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Npm3Q9CPP0 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Npm3Q9CPP0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Npm3Q9CPP0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Npm3Q9CPP0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Npm3Q9CPP0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms