Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GpnmbQ99P91 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GpnmbQ99P91 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GpnmbQ99P91 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GpnmbQ99P91 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GpnmbQ99P91 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GpnmbQ99P91 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GpnmbQ99P91 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GpnmbQ99P91 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GpnmbQ99P91 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GpnmbQ99P91 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GpnmbQ99P91 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GpnmbQ99P91 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GpnmbQ99P91 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GpnmbQ99P91 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GpnmbQ99P91 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GpnmbQ99P91 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
GpnmbQ99P91 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GpnmbQ99P91 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GpnmbQ99P91 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GpnmbQ99P91 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GpnmbQ99P91 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GpnmbQ99P91 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GpnmbQ99P91 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GpnmbQ99P91 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GpnmbQ99P91 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GpnmbQ99P91 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GpnmbQ99P91 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GpnmbQ99P91 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GpnmbQ99P91 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GpnmbQ99P91 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GpnmbQ99P91 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GpnmbQ99P91 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GpnmbQ99P91 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GpnmbQ99P91 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GpnmbQ99P91 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GpnmbQ99P91 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GpnmbQ99P91 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GpnmbQ99P91 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GpnmbQ99P91 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GpnmbQ99P91 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GpnmbQ99P91 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GpnmbQ99P91 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GpnmbQ99P91 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GpnmbQ99P91 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GpnmbQ99P91 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GpnmbQ99P91 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GpnmbQ99P91 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GpnmbQ99P91 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GpnmbQ99P91 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GpnmbQ99P91 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GpnmbQ99P91 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GpnmbQ99P91 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GpnmbQ99P91 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GpnmbQ99P91 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GpnmbQ99P91 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GpnmbQ99P91 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GpnmbQ99P91 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GpnmbQ99P91 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GpnmbQ99P91 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GpnmbQ99P91 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GpnmbQ99P91 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GpnmbQ99P91 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GpnmbQ99P91 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GpnmbQ99P91 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GpnmbQ99P91 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GpnmbQ99P91 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GpnmbQ99P91 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GpnmbQ99P91 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GpnmbQ99P91 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GpnmbQ99P91 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GpnmbQ99P91 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GpnmbQ99P91 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GpnmbQ99P91 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GpnmbQ99P91 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GpnmbQ99P91 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GpnmbQ99P91 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GpnmbQ99P91 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GpnmbQ99P91 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GpnmbQ99P91 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GpnmbQ99P91 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GpnmbQ99P91 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GpnmbQ99P91 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GpnmbQ99P91 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GpnmbQ99P91 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GpnmbQ99P91 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GpnmbQ99P91 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
GpnmbQ99P91 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GpnmbQ99P91 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GpnmbQ99P91 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GpnmbQ99P91 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GpnmbQ99P91 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GpnmbQ99P91 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GpnmbQ99P91 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GpnmbQ99P91 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GpnmbQ99P91 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GpnmbQ99P91 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GpnmbQ99P91 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GpnmbQ99P91 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GpnmbQ99P91 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms