Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF1

Bco2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco2Q99NF1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Bco2Q99NF1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bco2Q99NF1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bco2Q99NF1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bco2Q99NF1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Bco2Q99NF1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bco2Q99NF1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bco2Q99NF1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bco2Q99NF1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bco2Q99NF1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bco2Q99NF1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bco2Q99NF1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bco2Q99NF1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bco2Q99NF1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bco2Q99NF1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bco2Q99NF1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bco2Q99NF1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bco2Q99NF1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bco2Q99NF1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bco2Q99NF1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bco2Q99NF1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bco2Q99NF1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Bco2Q99NF1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bco2Q99NF1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bco2Q99NF1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bco2Q99NF1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bco2Q99NF1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bco2Q99NF1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bco2Q99NF1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bco2Q99NF1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bco2Q99NF1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bco2Q99NF1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bco2Q99NF1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bco2Q99NF1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Bco2Q99NF1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Bco2Q99NF1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Bco2Q99NF1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Bco2Q99NF1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Bco2Q99NF1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bco2Q99NF1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bco2Q99NF1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bco2Q99NF1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bco2Q99NF1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bco2Q99NF1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bco2Q99NF1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bco2Q99NF1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bco2Q99NF1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bco2Q99NF1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bco2Q99NF1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bco2Q99NF1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Bco2Q99NF1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bco2Q99NF1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bco2Q99NF1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Bco2Q99NF1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bco2Q99NF1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bco2Q99NF1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bco2Q99NF1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bco2Q99NF1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bco2Q99NF1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bco2Q99NF1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bco2Q99NF1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bco2Q99NF1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bco2Q99NF1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bco2Q99NF1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bco2Q99NF1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bco2Q99NF1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bco2Q99NF1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bco2Q99NF1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bco2Q99NF1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bco2Q99NF1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bco2Q99NF1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bco2Q99NF1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bco2Q99NF1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bco2Q99NF1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bco2Q99NF1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bco2Q99NF1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Bco2Q99NF1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bco2Q99NF1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bco2Q99NF1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bco2Q99NF1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Bco2Q99NF1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bco2Q99NF1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bco2Q99NF1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bco2Q99NF1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bco2Q99NF1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Bco2Q99NF1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bco2Q99NF1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bco2Q99NF1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bco2Q99NF1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bco2Q99NF1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bco2Q99NF1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bco2Q99NF1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bco2Q99NF1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bco2Q99NF1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bco2Q99NF1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bco2Q99NF1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bco2Q99NF1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bco2Q99NF1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bco2Q99NF1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bco2Q99NF1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms