Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tdrd1Q99MV1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tdrd1Q99MV1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tdrd1Q99MV1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tdrd1Q99MV1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tdrd1Q99MV1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tdrd1Q99MV1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tdrd1Q99MV1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tdrd1Q99MV1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tdrd1Q99MV1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tdrd1Q99MV1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tdrd1Q99MV1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Tdrd1Q99MV1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tdrd1Q99MV1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tdrd1Q99MV1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tdrd1Q99MV1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tdrd1Q99MV1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tdrd1Q99MV1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tdrd1Q99MV1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tdrd1Q99MV1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tdrd1Q99MV1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tdrd1Q99MV1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tdrd1Q99MV1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tdrd1Q99MV1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tdrd1Q99MV1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tdrd1Q99MV1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tdrd1Q99MV1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tdrd1Q99MV1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tdrd1Q99MV1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tdrd1Q99MV1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tdrd1Q99MV1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tdrd1Q99MV1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tdrd1Q99MV1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tdrd1Q99MV1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tdrd1Q99MV1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tdrd1Q99MV1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tdrd1Q99MV1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tdrd1Q99MV1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tdrd1Q99MV1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tdrd1Q99MV1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tdrd1Q99MV1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tdrd1Q99MV1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tdrd1Q99MV1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tdrd1Q99MV1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tdrd1Q99MV1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tdrd1Q99MV1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tdrd1Q99MV1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tdrd1Q99MV1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tdrd1Q99MV1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tdrd1Q99MV1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tdrd1Q99MV1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tdrd1Q99MV1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tdrd1Q99MV1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tdrd1Q99MV1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tdrd1Q99MV1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tdrd1Q99MV1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tdrd1Q99MV1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tdrd1Q99MV1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tdrd1Q99MV1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tdrd1Q99MV1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tdrd1Q99MV1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tdrd1Q99MV1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tdrd1Q99MV1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Tdrd1Q99MV1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tdrd1Q99MV1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tdrd1Q99MV1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Tdrd1Q99MV1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tdrd1Q99MV1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tdrd1Q99MV1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tdrd1Q99MV1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tdrd1Q99MV1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tdrd1Q99MV1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tdrd1Q99MV1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tdrd1Q99MV1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tdrd1Q99MV1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tdrd1Q99MV1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tdrd1Q99MV1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tdrd1Q99MV1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tdrd1Q99MV1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tdrd1Q99MV1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tdrd1Q99MV1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tdrd1Q99MV1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tdrd1Q99MV1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tdrd1Q99MV1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tdrd1Q99MV1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tdrd1Q99MV1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tdrd1Q99MV1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Tdrd1Q99MV1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tdrd1Q99MV1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tdrd1Q99MV1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Tdrd1Q99MV1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tdrd1Q99MV1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tdrd1Q99MV1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tdrd1Q99MV1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tdrd1Q99MV1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tdrd1Q99MV1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tdrd1Q99MV1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tdrd1Q99MV1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tdrd1Q99MV1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tdrd1Q99MV1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms