Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR3

Slc12a9, Solute carrier family 12 member 9, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a9Q99MR3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc12a9Q99MR3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc12a9Q99MR3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc12a9Q99MR3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc12a9Q99MR3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc12a9Q99MR3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc12a9Q99MR3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc12a9Q99MR3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc12a9Q99MR3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc12a9Q99MR3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc12a9Q99MR3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc12a9Q99MR3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc12a9Q99MR3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc12a9Q99MR3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc12a9Q99MR3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc12a9Q99MR3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc12a9Q99MR3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc12a9Q99MR3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc12a9Q99MR3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc12a9Q99MR3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc12a9Q99MR3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc12a9Q99MR3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc12a9Q99MR3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc12a9Q99MR3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc12a9Q99MR3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc12a9Q99MR3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc12a9Q99MR3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc12a9Q99MR3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc12a9Q99MR3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc12a9Q99MR3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc12a9Q99MR3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc12a9Q99MR3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc12a9Q99MR3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc12a9Q99MR3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc12a9Q99MR3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc12a9Q99MR3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc12a9Q99MR3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc12a9Q99MR3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc12a9Q99MR3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc12a9Q99MR3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc12a9Q99MR3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc12a9Q99MR3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Slc12a9Q99MR3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc12a9Q99MR3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc12a9Q99MR3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc12a9Q99MR3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc12a9Q99MR3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc12a9Q99MR3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc12a9Q99MR3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc12a9Q99MR3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc12a9Q99MR3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc12a9Q99MR3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc12a9Q99MR3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc12a9Q99MR3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc12a9Q99MR3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc12a9Q99MR3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc12a9Q99MR3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc12a9Q99MR3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc12a9Q99MR3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc12a9Q99MR3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc12a9Q99MR3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc12a9Q99MR3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc12a9Q99MR3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc12a9Q99MR3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc12a9Q99MR3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc12a9Q99MR3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc12a9Q99MR3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc12a9Q99MR3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc12a9Q99MR3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc12a9Q99MR3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc12a9Q99MR3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc12a9Q99MR3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc12a9Q99MR3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc12a9Q99MR3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc12a9Q99MR3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc12a9Q99MR3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc12a9Q99MR3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc12a9Q99MR3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc12a9Q99MR3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc12a9Q99MR3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc12a9Q99MR3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc12a9Q99MR3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc12a9Q99MR3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc12a9Q99MR3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc12a9Q99MR3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc12a9Q99MR3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc12a9Q99MR3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc12a9Q99MR3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc12a9Q99MR3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc12a9Q99MR3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc12a9Q99MR3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc12a9Q99MR3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc12a9Q99MR3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc12a9Q99MR3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc12a9Q99MR3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc12a9Q99MR3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc12a9Q99MR3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc12a9Q99MR3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc12a9Q99MR3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc12a9Q99MR3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms