Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB3

Tm2d1, TM2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d1Q99MB3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tm2d1Q99MB3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tm2d1Q99MB3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tm2d1Q99MB3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tm2d1Q99MB3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tm2d1Q99MB3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tm2d1Q99MB3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tm2d1Q99MB3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tm2d1Q99MB3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tm2d1Q99MB3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tm2d1Q99MB3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tm2d1Q99MB3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tm2d1Q99MB3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tm2d1Q99MB3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tm2d1Q99MB3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tm2d1Q99MB3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tm2d1Q99MB3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tm2d1Q99MB3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tm2d1Q99MB3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tm2d1Q99MB3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tm2d1Q99MB3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tm2d1Q99MB3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tm2d1Q99MB3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tm2d1Q99MB3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tm2d1Q99MB3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tm2d1Q99MB3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tm2d1Q99MB3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tm2d1Q99MB3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tm2d1Q99MB3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tm2d1Q99MB3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tm2d1Q99MB3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tm2d1Q99MB3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tm2d1Q99MB3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tm2d1Q99MB3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tm2d1Q99MB3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tm2d1Q99MB3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tm2d1Q99MB3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tm2d1Q99MB3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tm2d1Q99MB3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tm2d1Q99MB3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tm2d1Q99MB3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tm2d1Q99MB3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tm2d1Q99MB3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tm2d1Q99MB3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tm2d1Q99MB3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tm2d1Q99MB3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tm2d1Q99MB3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tm2d1Q99MB3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tm2d1Q99MB3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm2d1Q99MB3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm2d1Q99MB3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm2d1Q99MB3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm2d1Q99MB3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm2d1Q99MB3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm2d1Q99MB3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm2d1Q99MB3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm2d1Q99MB3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm2d1Q99MB3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm2d1Q99MB3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm2d1Q99MB3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm2d1Q99MB3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm2d1Q99MB3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm2d1Q99MB3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm2d1Q99MB3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm2d1Q99MB3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm2d1Q99MB3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm2d1Q99MB3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm2d1Q99MB3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm2d1Q99MB3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm2d1Q99MB3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm2d1Q99MB3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm2d1Q99MB3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm2d1Q99MB3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm2d1Q99MB3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm2d1Q99MB3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm2d1Q99MB3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm2d1Q99MB3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm2d1Q99MB3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm2d1Q99MB3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm2d1Q99MB3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm2d1Q99MB3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm2d1Q99MB3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm2d1Q99MB3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm2d1Q99MB3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm2d1Q99MB3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm2d1Q99MB3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm2d1Q99MB3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm2d1Q99MB3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm2d1Q99MB3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm2d1Q99MB3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm2d1Q99MB3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm2d1Q99MB3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm2d1Q99MB3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm2d1Q99MB3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm2d1Q99MB3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm2d1Q99MB3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm2d1Q99MB3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm2d1Q99MB3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm2d1Q99MB3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tm2d1Q99MB3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms