Protein–RNA interactions for Protein: Q99M87

Dnaja3, DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaja3Q99M87 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Dnaja3Q99M87 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dnaja3Q99M87 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dnaja3Q99M87 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dnaja3Q99M87 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dnaja3Q99M87 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dnaja3Q99M87 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dnaja3Q99M87 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dnaja3Q99M87 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dnaja3Q99M87 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dnaja3Q99M87 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dnaja3Q99M87 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dnaja3Q99M87 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dnaja3Q99M87 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dnaja3Q99M87 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dnaja3Q99M87 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dnaja3Q99M87 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dnaja3Q99M87 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dnaja3Q99M87 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dnaja3Q99M87 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dnaja3Q99M87 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dnaja3Q99M87 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Dnaja3Q99M87 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dnaja3Q99M87 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dnaja3Q99M87 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dnaja3Q99M87 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dnaja3Q99M87 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Dnaja3Q99M87 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dnaja3Q99M87 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dnaja3Q99M87 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dnaja3Q99M87 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dnaja3Q99M87 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dnaja3Q99M87 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dnaja3Q99M87 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dnaja3Q99M87 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Dnaja3Q99M87 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Dnaja3Q99M87 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Dnaja3Q99M87 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dnaja3Q99M87 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dnaja3Q99M87 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dnaja3Q99M87 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dnaja3Q99M87 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dnaja3Q99M87 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dnaja3Q99M87 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dnaja3Q99M87 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dnaja3Q99M87 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dnaja3Q99M87 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dnaja3Q99M87 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dnaja3Q99M87 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Dnaja3Q99M87 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Dnaja3Q99M87 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dnaja3Q99M87 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Dnaja3Q99M87 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dnaja3Q99M87 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dnaja3Q99M87 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dnaja3Q99M87 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dnaja3Q99M87 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Dnaja3Q99M87 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnaja3Q99M87 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnaja3Q99M87 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnaja3Q99M87 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnaja3Q99M87 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnaja3Q99M87 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnaja3Q99M87 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnaja3Q99M87 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnaja3Q99M87 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnaja3Q99M87 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnaja3Q99M87 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnaja3Q99M87 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnaja3Q99M87 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnaja3Q99M87 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnaja3Q99M87 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnaja3Q99M87 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnaja3Q99M87 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnaja3Q99M87 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dnaja3Q99M87 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dnaja3Q99M87 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dnaja3Q99M87 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dnaja3Q99M87 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dnaja3Q99M87 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dnaja3Q99M87 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dnaja3Q99M87 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dnaja3Q99M87 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dnaja3Q99M87 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dnaja3Q99M87 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dnaja3Q99M87 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dnaja3Q99M87 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dnaja3Q99M87 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dnaja3Q99M87 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dnaja3Q99M87 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dnaja3Q99M87 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dnaja3Q99M87 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dnaja3Q99M87 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dnaja3Q99M87 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dnaja3Q99M87 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dnaja3Q99M87 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Dnaja3Q99M87 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dnaja3Q99M87 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dnaja3Q99M87 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dnaja3Q99M87 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.4 ms