Protein–RNA interactions for Protein: Q99M71

Epdr1, Mammalian ependymin-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epdr1Q99M71 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Epdr1Q99M71 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Epdr1Q99M71 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Epdr1Q99M71 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Epdr1Q99M71 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Epdr1Q99M71 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Epdr1Q99M71 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Epdr1Q99M71 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Epdr1Q99M71 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Epdr1Q99M71 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Epdr1Q99M71 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epdr1Q99M71 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epdr1Q99M71 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epdr1Q99M71 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epdr1Q99M71 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epdr1Q99M71 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epdr1Q99M71 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epdr1Q99M71 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epdr1Q99M71 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epdr1Q99M71 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epdr1Q99M71 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Epdr1Q99M71 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epdr1Q99M71 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epdr1Q99M71 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epdr1Q99M71 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epdr1Q99M71 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epdr1Q99M71 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epdr1Q99M71 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epdr1Q99M71 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epdr1Q99M71 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epdr1Q99M71 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epdr1Q99M71 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epdr1Q99M71 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epdr1Q99M71 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epdr1Q99M71 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epdr1Q99M71 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epdr1Q99M71 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epdr1Q99M71 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epdr1Q99M71 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epdr1Q99M71 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epdr1Q99M71 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epdr1Q99M71 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epdr1Q99M71 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epdr1Q99M71 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epdr1Q99M71 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epdr1Q99M71 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epdr1Q99M71 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epdr1Q99M71 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epdr1Q99M71 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epdr1Q99M71 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epdr1Q99M71 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epdr1Q99M71 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epdr1Q99M71 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epdr1Q99M71 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epdr1Q99M71 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epdr1Q99M71 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epdr1Q99M71 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epdr1Q99M71 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epdr1Q99M71 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epdr1Q99M71 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epdr1Q99M71 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epdr1Q99M71 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epdr1Q99M71 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epdr1Q99M71 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epdr1Q99M71 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Epdr1Q99M71 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epdr1Q99M71 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epdr1Q99M71 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epdr1Q99M71 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epdr1Q99M71 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epdr1Q99M71 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epdr1Q99M71 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epdr1Q99M71 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epdr1Q99M71 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epdr1Q99M71 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epdr1Q99M71 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epdr1Q99M71 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epdr1Q99M71 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epdr1Q99M71 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epdr1Q99M71 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epdr1Q99M71 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epdr1Q99M71 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epdr1Q99M71 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epdr1Q99M71 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epdr1Q99M71 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epdr1Q99M71 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epdr1Q99M71 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epdr1Q99M71 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epdr1Q99M71 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epdr1Q99M71 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epdr1Q99M71 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epdr1Q99M71 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epdr1Q99M71 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Epdr1Q99M71 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epdr1Q99M71 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epdr1Q99M71 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epdr1Q99M71 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epdr1Q99M71 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epdr1Q99M71 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epdr1Q99M71 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms