Protein–RNA interactions for Protein: Q99LS3

Psph, Phosphoserine phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PsphQ99LS3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PsphQ99LS3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PsphQ99LS3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PsphQ99LS3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PsphQ99LS3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PsphQ99LS3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PsphQ99LS3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PsphQ99LS3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PsphQ99LS3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PsphQ99LS3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PsphQ99LS3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PsphQ99LS3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PsphQ99LS3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PsphQ99LS3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PsphQ99LS3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PsphQ99LS3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PsphQ99LS3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PsphQ99LS3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PsphQ99LS3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PsphQ99LS3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PsphQ99LS3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PsphQ99LS3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PsphQ99LS3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PsphQ99LS3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PsphQ99LS3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PsphQ99LS3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PsphQ99LS3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PsphQ99LS3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PsphQ99LS3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PsphQ99LS3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PsphQ99LS3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PsphQ99LS3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PsphQ99LS3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PsphQ99LS3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PsphQ99LS3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PsphQ99LS3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PsphQ99LS3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PsphQ99LS3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PsphQ99LS3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PsphQ99LS3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PsphQ99LS3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PsphQ99LS3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PsphQ99LS3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PsphQ99LS3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PsphQ99LS3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PsphQ99LS3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PsphQ99LS3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PsphQ99LS3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PsphQ99LS3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PsphQ99LS3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PsphQ99LS3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PsphQ99LS3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PsphQ99LS3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PsphQ99LS3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PsphQ99LS3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PsphQ99LS3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PsphQ99LS3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PsphQ99LS3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PsphQ99LS3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PsphQ99LS3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PsphQ99LS3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PsphQ99LS3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PsphQ99LS3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PsphQ99LS3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PsphQ99LS3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PsphQ99LS3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PsphQ99LS3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PsphQ99LS3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PsphQ99LS3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PsphQ99LS3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PsphQ99LS3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PsphQ99LS3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PsphQ99LS3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PsphQ99LS3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PsphQ99LS3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PsphQ99LS3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PsphQ99LS3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PsphQ99LS3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PsphQ99LS3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PsphQ99LS3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PsphQ99LS3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PsphQ99LS3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PsphQ99LS3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PsphQ99LS3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PsphQ99LS3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PsphQ99LS3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PsphQ99LS3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PsphQ99LS3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PsphQ99LS3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PsphQ99LS3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PsphQ99LS3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PsphQ99LS3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PsphQ99LS3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PsphQ99LS3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PsphQ99LS3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PsphQ99LS3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PsphQ99LS3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PsphQ99LS3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PsphQ99LS3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PsphQ99LS3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms