Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ5

Cmtm3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm3Q99LJ5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cmtm3Q99LJ5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cmtm3Q99LJ5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cmtm3Q99LJ5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cmtm3Q99LJ5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cmtm3Q99LJ5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cmtm3Q99LJ5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cmtm3Q99LJ5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cmtm3Q99LJ5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cmtm3Q99LJ5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cmtm3Q99LJ5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cmtm3Q99LJ5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cmtm3Q99LJ5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cmtm3Q99LJ5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cmtm3Q99LJ5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cmtm3Q99LJ5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cmtm3Q99LJ5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cmtm3Q99LJ5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cmtm3Q99LJ5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cmtm3Q99LJ5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cmtm3Q99LJ5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cmtm3Q99LJ5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cmtm3Q99LJ5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cmtm3Q99LJ5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cmtm3Q99LJ5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cmtm3Q99LJ5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cmtm3Q99LJ5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cmtm3Q99LJ5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cmtm3Q99LJ5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cmtm3Q99LJ5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cmtm3Q99LJ5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cmtm3Q99LJ5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cmtm3Q99LJ5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cmtm3Q99LJ5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cmtm3Q99LJ5 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cmtm3Q99LJ5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cmtm3Q99LJ5 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cmtm3Q99LJ5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cmtm3Q99LJ5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cmtm3Q99LJ5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cmtm3Q99LJ5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cmtm3Q99LJ5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cmtm3Q99LJ5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cmtm3Q99LJ5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cmtm3Q99LJ5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cmtm3Q99LJ5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cmtm3Q99LJ5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cmtm3Q99LJ5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cmtm3Q99LJ5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cmtm3Q99LJ5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cmtm3Q99LJ5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cmtm3Q99LJ5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cmtm3Q99LJ5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cmtm3Q99LJ5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cmtm3Q99LJ5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cmtm3Q99LJ5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cmtm3Q99LJ5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cmtm3Q99LJ5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cmtm3Q99LJ5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cmtm3Q99LJ5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cmtm3Q99LJ5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cmtm3Q99LJ5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cmtm3Q99LJ5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cmtm3Q99LJ5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cmtm3Q99LJ5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cmtm3Q99LJ5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cmtm3Q99LJ5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cmtm3Q99LJ5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cmtm3Q99LJ5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cmtm3Q99LJ5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cmtm3Q99LJ5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cmtm3Q99LJ5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cmtm3Q99LJ5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cmtm3Q99LJ5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cmtm3Q99LJ5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cmtm3Q99LJ5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cmtm3Q99LJ5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cmtm3Q99LJ5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cmtm3Q99LJ5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cmtm3Q99LJ5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cmtm3Q99LJ5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cmtm3Q99LJ5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cmtm3Q99LJ5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cmtm3Q99LJ5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cmtm3Q99LJ5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cmtm3Q99LJ5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cmtm3Q99LJ5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cmtm3Q99LJ5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cmtm3Q99LJ5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cmtm3Q99LJ5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cmtm3Q99LJ5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cmtm3Q99LJ5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cmtm3Q99LJ5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cmtm3Q99LJ5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cmtm3Q99LJ5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cmtm3Q99LJ5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cmtm3Q99LJ5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cmtm3Q99LJ5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cmtm3Q99LJ5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cmtm3Q99LJ5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms