Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cstf3Q99LI7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cstf3Q99LI7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cstf3Q99LI7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cstf3Q99LI7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cstf3Q99LI7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cstf3Q99LI7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cstf3Q99LI7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cstf3Q99LI7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cstf3Q99LI7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cstf3Q99LI7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cstf3Q99LI7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cstf3Q99LI7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cstf3Q99LI7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cstf3Q99LI7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cstf3Q99LI7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cstf3Q99LI7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cstf3Q99LI7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cstf3Q99LI7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cstf3Q99LI7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cstf3Q99LI7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Cstf3Q99LI7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cstf3Q99LI7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Cstf3Q99LI7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cstf3Q99LI7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cstf3Q99LI7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cstf3Q99LI7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cstf3Q99LI7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cstf3Q99LI7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cstf3Q99LI7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cstf3Q99LI7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cstf3Q99LI7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cstf3Q99LI7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cstf3Q99LI7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cstf3Q99LI7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cstf3Q99LI7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cstf3Q99LI7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cstf3Q99LI7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cstf3Q99LI7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cstf3Q99LI7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cstf3Q99LI7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cstf3Q99LI7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cstf3Q99LI7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cstf3Q99LI7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cstf3Q99LI7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cstf3Q99LI7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cstf3Q99LI7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cstf3Q99LI7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cstf3Q99LI7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cstf3Q99LI7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cstf3Q99LI7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cstf3Q99LI7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cstf3Q99LI7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cstf3Q99LI7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cstf3Q99LI7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cstf3Q99LI7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cstf3Q99LI7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cstf3Q99LI7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cstf3Q99LI7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cstf3Q99LI7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cstf3Q99LI7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cstf3Q99LI7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cstf3Q99LI7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cstf3Q99LI7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cstf3Q99LI7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cstf3Q99LI7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cstf3Q99LI7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cstf3Q99LI7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cstf3Q99LI7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cstf3Q99LI7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cstf3Q99LI7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cstf3Q99LI7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cstf3Q99LI7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cstf3Q99LI7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cstf3Q99LI7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cstf3Q99LI7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cstf3Q99LI7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cstf3Q99LI7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cstf3Q99LI7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cstf3Q99LI7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cstf3Q99LI7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cstf3Q99LI7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cstf3Q99LI7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cstf3Q99LI7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cstf3Q99LI7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cstf3Q99LI7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cstf3Q99LI7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cstf3Q99LI7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cstf3Q99LI7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cstf3Q99LI7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cstf3Q99LI7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cstf3Q99LI7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cstf3Q99LI7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cstf3Q99LI7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cstf3Q99LI7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cstf3Q99LI7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cstf3Q99LI7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cstf3Q99LI7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cstf3Q99LI7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cstf3Q99LI7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms