Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Sh3bp5lQ99LH9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sh3bp5lQ99LH9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Sh3bp5lQ99LH9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sh3bp5lQ99LH9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sh3bp5lQ99LH9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sh3bp5lQ99LH9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sh3bp5lQ99LH9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sh3bp5lQ99LH9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sh3bp5lQ99LH9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sh3bp5lQ99LH9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sh3bp5lQ99LH9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sh3bp5lQ99LH9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sh3bp5lQ99LH9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sh3bp5lQ99LH9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sh3bp5lQ99LH9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sh3bp5lQ99LH9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sh3bp5lQ99LH9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sh3bp5lQ99LH9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Sh3bp5lQ99LH9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sh3bp5lQ99LH9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sh3bp5lQ99LH9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sh3bp5lQ99LH9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sh3bp5lQ99LH9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sh3bp5lQ99LH9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sh3bp5lQ99LH9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sh3bp5lQ99LH9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sh3bp5lQ99LH9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Sh3bp5lQ99LH9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sh3bp5lQ99LH9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sh3bp5lQ99LH9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sh3bp5lQ99LH9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sh3bp5lQ99LH9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sh3bp5lQ99LH9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sh3bp5lQ99LH9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sh3bp5lQ99LH9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sh3bp5lQ99LH9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sh3bp5lQ99LH9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sh3bp5lQ99LH9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sh3bp5lQ99LH9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sh3bp5lQ99LH9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sh3bp5lQ99LH9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sh3bp5lQ99LH9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sh3bp5lQ99LH9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sh3bp5lQ99LH9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sh3bp5lQ99LH9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Sh3bp5lQ99LH9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sh3bp5lQ99LH9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sh3bp5lQ99LH9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sh3bp5lQ99LH9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sh3bp5lQ99LH9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sh3bp5lQ99LH9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sh3bp5lQ99LH9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Sh3bp5lQ99LH9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sh3bp5lQ99LH9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sh3bp5lQ99LH9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sh3bp5lQ99LH9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sh3bp5lQ99LH9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sh3bp5lQ99LH9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sh3bp5lQ99LH9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sh3bp5lQ99LH9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sh3bp5lQ99LH9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sh3bp5lQ99LH9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sh3bp5lQ99LH9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sh3bp5lQ99LH9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sh3bp5lQ99LH9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sh3bp5lQ99LH9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sh3bp5lQ99LH9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sh3bp5lQ99LH9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sh3bp5lQ99LH9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sh3bp5lQ99LH9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sh3bp5lQ99LH9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sh3bp5lQ99LH9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sh3bp5lQ99LH9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sh3bp5lQ99LH9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sh3bp5lQ99LH9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sh3bp5lQ99LH9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sh3bp5lQ99LH9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sh3bp5lQ99LH9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sh3bp5lQ99LH9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sh3bp5lQ99LH9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sh3bp5lQ99LH9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sh3bp5lQ99LH9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sh3bp5lQ99LH9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sh3bp5lQ99LH9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sh3bp5lQ99LH9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sh3bp5lQ99LH9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sh3bp5lQ99LH9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sh3bp5lQ99LH9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sh3bp5lQ99LH9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sh3bp5lQ99LH9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sh3bp5lQ99LH9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sh3bp5lQ99LH9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sh3bp5lQ99LH9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sh3bp5lQ99LH9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sh3bp5lQ99LH9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Sh3bp5lQ99LH9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
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