Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF1

Akirin1, Akirin-1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Akirin1Q99LF1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Akirin1Q99LF1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Akirin1Q99LF1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Akirin1Q99LF1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Akirin1Q99LF1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Akirin1Q99LF1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Akirin1Q99LF1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Akirin1Q99LF1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Akirin1Q99LF1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Akirin1Q99LF1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Akirin1Q99LF1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Akirin1Q99LF1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Akirin1Q99LF1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Akirin1Q99LF1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Akirin1Q99LF1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Akirin1Q99LF1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Akirin1Q99LF1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
Akirin1Q99LF1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Akirin1Q99LF1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Akirin1Q99LF1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Akirin1Q99LF1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Akirin1Q99LF1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Akirin1Q99LF1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Akirin1Q99LF1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Akirin1Q99LF1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Akirin1Q99LF1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Akirin1Q99LF1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Akirin1Q99LF1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Akirin1Q99LF1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Akirin1Q99LF1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Akirin1Q99LF1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Akirin1Q99LF1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Akirin1Q99LF1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Akirin1Q99LF1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Akirin1Q99LF1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Akirin1Q99LF1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Akirin1Q99LF1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Akirin1Q99LF1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Akirin1Q99LF1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Akirin1Q99LF1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Akirin1Q99LF1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Akirin1Q99LF1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Akirin1Q99LF1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Akirin1Q99LF1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Akirin1Q99LF1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Akirin1Q99LF1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Akirin1Q99LF1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Akirin1Q99LF1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Akirin1Q99LF1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Akirin1Q99LF1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Akirin1Q99LF1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Akirin1Q99LF1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Akirin1Q99LF1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Akirin1Q99LF1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Akirin1Q99LF1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Akirin1Q99LF1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Akirin1Q99LF1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Akirin1Q99LF1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Akirin1Q99LF1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Akirin1Q99LF1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Akirin1Q99LF1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Akirin1Q99LF1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Akirin1Q99LF1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Akirin1Q99LF1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Akirin1Q99LF1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Akirin1Q99LF1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Akirin1Q99LF1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Akirin1Q99LF1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Akirin1Q99LF1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Akirin1Q99LF1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Akirin1Q99LF1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Akirin1Q99LF1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Akirin1Q99LF1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Akirin1Q99LF1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Akirin1Q99LF1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Akirin1Q99LF1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Akirin1Q99LF1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Akirin1Q99LF1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Akirin1Q99LF1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Akirin1Q99LF1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Akirin1Q99LF1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Akirin1Q99LF1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Akirin1Q99LF1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Akirin1Q99LF1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Akirin1Q99LF1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Akirin1Q99LF1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Akirin1Q99LF1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Akirin1Q99LF1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Akirin1Q99LF1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Akirin1Q99LF1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Akirin1Q99LF1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Akirin1Q99LF1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Akirin1Q99LF1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Akirin1Q99LF1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Akirin1Q99LF1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Akirin1Q99LF1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Akirin1Q99LF1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Akirin1Q99LF1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Akirin1Q99LF1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Akirin1Q99LF1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms