Protein–RNA interactions for Protein: Q99L43

Cds2, Phosphatidate cytidylyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds2Q99L43 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cds2Q99L43 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cds2Q99L43 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cds2Q99L43 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cds2Q99L43 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cds2Q99L43 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cds2Q99L43 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cds2Q99L43 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cds2Q99L43 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cds2Q99L43 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cds2Q99L43 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cds2Q99L43 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cds2Q99L43 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cds2Q99L43 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cds2Q99L43 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cds2Q99L43 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cds2Q99L43 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cds2Q99L43 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cds2Q99L43 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cds2Q99L43 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cds2Q99L43 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cds2Q99L43 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cds2Q99L43 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cds2Q99L43 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cds2Q99L43 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cds2Q99L43 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cds2Q99L43 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cds2Q99L43 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cds2Q99L43 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cds2Q99L43 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cds2Q99L43 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cds2Q99L43 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cds2Q99L43 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cds2Q99L43 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cds2Q99L43 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cds2Q99L43 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cds2Q99L43 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cds2Q99L43 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cds2Q99L43 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cds2Q99L43 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cds2Q99L43 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cds2Q99L43 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cds2Q99L43 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cds2Q99L43 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cds2Q99L43 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cds2Q99L43 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cds2Q99L43 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cds2Q99L43 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cds2Q99L43 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cds2Q99L43 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cds2Q99L43 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cds2Q99L43 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cds2Q99L43 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cds2Q99L43 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cds2Q99L43 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cds2Q99L43 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cds2Q99L43 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cds2Q99L43 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cds2Q99L43 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cds2Q99L43 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cds2Q99L43 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cds2Q99L43 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cds2Q99L43 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cds2Q99L43 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cds2Q99L43 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cds2Q99L43 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cds2Q99L43 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cds2Q99L43 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cds2Q99L43 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cds2Q99L43 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cds2Q99L43 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cds2Q99L43 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cds2Q99L43 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cds2Q99L43 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cds2Q99L43 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cds2Q99L43 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cds2Q99L43 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cds2Q99L43 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cds2Q99L43 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cds2Q99L43 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cds2Q99L43 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cds2Q99L43 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cds2Q99L43 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cds2Q99L43 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cds2Q99L43 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cds2Q99L43 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cds2Q99L43 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cds2Q99L43 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cds2Q99L43 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cds2Q99L43 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cds2Q99L43 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cds2Q99L43 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cds2Q99L43 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cds2Q99L43 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cds2Q99L43 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cds2Q99L43 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cds2Q99L43 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cds2Q99L43 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cds2Q99L43 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cds2Q99L43 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms