Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Q99KU6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Q99KU6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Q99KU6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Q99KU6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Q99KU6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Q99KU6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Q99KU6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Q99KU6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Q99KU6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Q99KU6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Q99KU6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Q99KU6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Q99KU6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Q99KU6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Q99KU6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Q99KU6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Q99KU6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Q99KU6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Q99KU6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Q99KU6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Q99KU6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Q99KU6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Q99KU6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Q99KU6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Q99KU6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Q99KU6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Q99KU6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Q99KU6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Q99KU6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Q99KU6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Q99KU6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Q99KU6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Q99KU6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Q99KU6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Q99KU6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Q99KU6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Q99KU6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Q99KU6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Q99KU6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Q99KU6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Q99KU6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Q99KU6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Q99KU6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Q99KU6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Q99KU6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Q99KU6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Q99KU6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Q99KU6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Q99KU6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Q99KU6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Q99KU6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Q99KU6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Q99KU6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Q99KU6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Q99KU6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Q99KU6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Q99KU6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Q99KU6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Q99KU6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Q99KU6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Q99KU6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Q99KU6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Q99KU6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Q99KU6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Q99KU6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Q99KU6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Q99KU6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Q99KU6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Q99KU6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Q99KU6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Q99KU6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Q99KU6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Q99KU6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Q99KU6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Q99KU6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Q99KU6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Q99KU6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Q99KU6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Q99KU6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Q99KU6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Q99KU6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Q99KU6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Q99KU6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Q99KU6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Q99KU6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Q99KU6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Q99KU6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Q99KU6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Q99KU6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Q99KU6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Q99KU6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Q99KU6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Q99KU6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Q99KU6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Q99KU6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Q99KU6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Q99KU6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Q99KU6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Q99KU6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 294.3 ms