Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR7

Ppif, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpifQ99KR7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PpifQ99KR7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PpifQ99KR7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PpifQ99KR7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PpifQ99KR7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PpifQ99KR7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PpifQ99KR7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PpifQ99KR7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PpifQ99KR7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PpifQ99KR7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PpifQ99KR7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PpifQ99KR7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PpifQ99KR7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PpifQ99KR7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PpifQ99KR7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PpifQ99KR7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PpifQ99KR7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PpifQ99KR7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PpifQ99KR7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PpifQ99KR7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PpifQ99KR7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PpifQ99KR7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PpifQ99KR7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PpifQ99KR7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PpifQ99KR7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PpifQ99KR7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PpifQ99KR7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PpifQ99KR7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PpifQ99KR7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PpifQ99KR7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PpifQ99KR7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PpifQ99KR7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PpifQ99KR7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PpifQ99KR7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PpifQ99KR7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PpifQ99KR7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PpifQ99KR7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PpifQ99KR7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PpifQ99KR7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PpifQ99KR7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PpifQ99KR7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PpifQ99KR7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PpifQ99KR7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PpifQ99KR7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PpifQ99KR7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PpifQ99KR7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PpifQ99KR7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PpifQ99KR7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PpifQ99KR7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PpifQ99KR7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PpifQ99KR7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PpifQ99KR7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PpifQ99KR7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PpifQ99KR7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PpifQ99KR7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PpifQ99KR7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PpifQ99KR7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PpifQ99KR7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PpifQ99KR7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PpifQ99KR7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PpifQ99KR7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PpifQ99KR7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PpifQ99KR7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PpifQ99KR7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PpifQ99KR7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms