Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prpf19Q99KP6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prpf19Q99KP6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prpf19Q99KP6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prpf19Q99KP6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prpf19Q99KP6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prpf19Q99KP6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prpf19Q99KP6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prpf19Q99KP6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prpf19Q99KP6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Prpf19Q99KP6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prpf19Q99KP6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prpf19Q99KP6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prpf19Q99KP6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prpf19Q99KP6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prpf19Q99KP6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prpf19Q99KP6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prpf19Q99KP6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prpf19Q99KP6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prpf19Q99KP6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prpf19Q99KP6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prpf19Q99KP6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prpf19Q99KP6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prpf19Q99KP6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prpf19Q99KP6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prpf19Q99KP6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Prpf19Q99KP6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prpf19Q99KP6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prpf19Q99KP6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prpf19Q99KP6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prpf19Q99KP6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prpf19Q99KP6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Prpf19Q99KP6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prpf19Q99KP6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prpf19Q99KP6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prpf19Q99KP6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prpf19Q99KP6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prpf19Q99KP6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prpf19Q99KP6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prpf19Q99KP6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prpf19Q99KP6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prpf19Q99KP6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prpf19Q99KP6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prpf19Q99KP6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prpf19Q99KP6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prpf19Q99KP6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prpf19Q99KP6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prpf19Q99KP6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prpf19Q99KP6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prpf19Q99KP6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prpf19Q99KP6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prpf19Q99KP6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prpf19Q99KP6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prpf19Q99KP6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prpf19Q99KP6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prpf19Q99KP6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Prpf19Q99KP6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prpf19Q99KP6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prpf19Q99KP6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prpf19Q99KP6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prpf19Q99KP6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prpf19Q99KP6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prpf19Q99KP6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prpf19Q99KP6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prpf19Q99KP6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prpf19Q99KP6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prpf19Q99KP6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prpf19Q99KP6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prpf19Q99KP6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prpf19Q99KP6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prpf19Q99KP6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prpf19Q99KP6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prpf19Q99KP6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prpf19Q99KP6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prpf19Q99KP6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prpf19Q99KP6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prpf19Q99KP6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prpf19Q99KP6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prpf19Q99KP6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prpf19Q99KP6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prpf19Q99KP6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prpf19Q99KP6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prpf19Q99KP6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prpf19Q99KP6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prpf19Q99KP6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prpf19Q99KP6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prpf19Q99KP6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prpf19Q99KP6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prpf19Q99KP6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prpf19Q99KP6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prpf19Q99KP6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prpf19Q99KP6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prpf19Q99KP6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prpf19Q99KP6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prpf19Q99KP6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prpf19Q99KP6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prpf19Q99KP6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prpf19Q99KP6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prpf19Q99KP6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prpf19Q99KP6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms