Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN9

Clint1, Clathrin interactor 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clint1Q99KN9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clint1Q99KN9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clint1Q99KN9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clint1Q99KN9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Clint1Q99KN9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Clint1Q99KN9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clint1Q99KN9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clint1Q99KN9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clint1Q99KN9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clint1Q99KN9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clint1Q99KN9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Clint1Q99KN9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clint1Q99KN9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Clint1Q99KN9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clint1Q99KN9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clint1Q99KN9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clint1Q99KN9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clint1Q99KN9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clint1Q99KN9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clint1Q99KN9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clint1Q99KN9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clint1Q99KN9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clint1Q99KN9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clint1Q99KN9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clint1Q99KN9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clint1Q99KN9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clint1Q99KN9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clint1Q99KN9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clint1Q99KN9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clint1Q99KN9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clint1Q99KN9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clint1Q99KN9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clint1Q99KN9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clint1Q99KN9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clint1Q99KN9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clint1Q99KN9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clint1Q99KN9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clint1Q99KN9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clint1Q99KN9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clint1Q99KN9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clint1Q99KN9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clint1Q99KN9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clint1Q99KN9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Clint1Q99KN9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Clint1Q99KN9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clint1Q99KN9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clint1Q99KN9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clint1Q99KN9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clint1Q99KN9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clint1Q99KN9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clint1Q99KN9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clint1Q99KN9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clint1Q99KN9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clint1Q99KN9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clint1Q99KN9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clint1Q99KN9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clint1Q99KN9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clint1Q99KN9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Clint1Q99KN9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clint1Q99KN9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clint1Q99KN9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clint1Q99KN9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Clint1Q99KN9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Clint1Q99KN9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clint1Q99KN9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clint1Q99KN9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clint1Q99KN9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clint1Q99KN9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clint1Q99KN9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clint1Q99KN9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clint1Q99KN9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clint1Q99KN9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clint1Q99KN9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clint1Q99KN9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clint1Q99KN9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clint1Q99KN9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clint1Q99KN9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clint1Q99KN9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clint1Q99KN9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Clint1Q99KN9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Clint1Q99KN9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Clint1Q99KN9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Clint1Q99KN9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Clint1Q99KN9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms