Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hps4Q99KG7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hps4Q99KG7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hps4Q99KG7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hps4Q99KG7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hps4Q99KG7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hps4Q99KG7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hps4Q99KG7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hps4Q99KG7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hps4Q99KG7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hps4Q99KG7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hps4Q99KG7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Hps4Q99KG7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hps4Q99KG7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hps4Q99KG7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hps4Q99KG7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hps4Q99KG7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hps4Q99KG7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hps4Q99KG7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hps4Q99KG7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hps4Q99KG7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Hps4Q99KG7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hps4Q99KG7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hps4Q99KG7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hps4Q99KG7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hps4Q99KG7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hps4Q99KG7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hps4Q99KG7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hps4Q99KG7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hps4Q99KG7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hps4Q99KG7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hps4Q99KG7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hps4Q99KG7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hps4Q99KG7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hps4Q99KG7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hps4Q99KG7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hps4Q99KG7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hps4Q99KG7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hps4Q99KG7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hps4Q99KG7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Hps4Q99KG7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hps4Q99KG7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hps4Q99KG7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hps4Q99KG7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hps4Q99KG7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hps4Q99KG7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Hps4Q99KG7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hps4Q99KG7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hps4Q99KG7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hps4Q99KG7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hps4Q99KG7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hps4Q99KG7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hps4Q99KG7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Hps4Q99KG7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hps4Q99KG7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hps4Q99KG7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hps4Q99KG7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hps4Q99KG7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hps4Q99KG7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hps4Q99KG7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hps4Q99KG7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hps4Q99KG7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hps4Q99KG7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hps4Q99KG7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hps4Q99KG7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hps4Q99KG7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hps4Q99KG7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hps4Q99KG7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hps4Q99KG7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hps4Q99KG7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hps4Q99KG7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hps4Q99KG7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hps4Q99KG7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hps4Q99KG7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hps4Q99KG7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hps4Q99KG7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hps4Q99KG7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hps4Q99KG7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Hps4Q99KG7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hps4Q99KG7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hps4Q99KG7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hps4Q99KG7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hps4Q99KG7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hps4Q99KG7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hps4Q99KG7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hps4Q99KG7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hps4Q99KG7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hps4Q99KG7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hps4Q99KG7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hps4Q99KG7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hps4Q99KG7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hps4Q99KG7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hps4Q99KG7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hps4Q99KG7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hps4Q99KG7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hps4Q99KG7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hps4Q99KG7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hps4Q99KG7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hps4Q99KG7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hps4Q99KG7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms