Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmed9Q99KF1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmed9Q99KF1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmed9Q99KF1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmed9Q99KF1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmed9Q99KF1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmed9Q99KF1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmed9Q99KF1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmed9Q99KF1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmed9Q99KF1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmed9Q99KF1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmed9Q99KF1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmed9Q99KF1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmed9Q99KF1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmed9Q99KF1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmed9Q99KF1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmed9Q99KF1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmed9Q99KF1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmed9Q99KF1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmed9Q99KF1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmed9Q99KF1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmed9Q99KF1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmed9Q99KF1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmed9Q99KF1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmed9Q99KF1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmed9Q99KF1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmed9Q99KF1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmed9Q99KF1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmed9Q99KF1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmed9Q99KF1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmed9Q99KF1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmed9Q99KF1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmed9Q99KF1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmed9Q99KF1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmed9Q99KF1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmed9Q99KF1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmed9Q99KF1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmed9Q99KF1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmed9Q99KF1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmed9Q99KF1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmed9Q99KF1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmed9Q99KF1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmed9Q99KF1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmed9Q99KF1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmed9Q99KF1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmed9Q99KF1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmed9Q99KF1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmed9Q99KF1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmed9Q99KF1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmed9Q99KF1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmed9Q99KF1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmed9Q99KF1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmed9Q99KF1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmed9Q99KF1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmed9Q99KF1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmed9Q99KF1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmed9Q99KF1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmed9Q99KF1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmed9Q99KF1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmed9Q99KF1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmed9Q99KF1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmed9Q99KF1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmed9Q99KF1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmed9Q99KF1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmed9Q99KF1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmed9Q99KF1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmed9Q99KF1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmed9Q99KF1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmed9Q99KF1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmed9Q99KF1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmed9Q99KF1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmed9Q99KF1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmed9Q99KF1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmed9Q99KF1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmed9Q99KF1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmed9Q99KF1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmed9Q99KF1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmed9Q99KF1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmed9Q99KF1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmed9Q99KF1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmed9Q99KF1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmed9Q99KF1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmed9Q99KF1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmed9Q99KF1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmed9Q99KF1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmed9Q99KF1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmed9Q99KF1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmed9Q99KF1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmed9Q99KF1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmed9Q99KF1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmed9Q99KF1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmed9Q99KF1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmed9Q99KF1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmed9Q99KF1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmed9Q99KF1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmed9Q99KF1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmed9Q99KF1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmed9Q99KF1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmed9Q99KF1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmed9Q99KF1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms