Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Higd1bQ99JY6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Higd1bQ99JY6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Higd1bQ99JY6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Higd1bQ99JY6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Higd1bQ99JY6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Higd1bQ99JY6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Higd1bQ99JY6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Higd1bQ99JY6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Higd1bQ99JY6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Higd1bQ99JY6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Higd1bQ99JY6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Higd1bQ99JY6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Higd1bQ99JY6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Higd1bQ99JY6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Higd1bQ99JY6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Higd1bQ99JY6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms