Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TrabdQ99JY4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TrabdQ99JY4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TrabdQ99JY4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TrabdQ99JY4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TrabdQ99JY4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TrabdQ99JY4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TrabdQ99JY4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TrabdQ99JY4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TrabdQ99JY4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TrabdQ99JY4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TrabdQ99JY4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TrabdQ99JY4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TrabdQ99JY4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TrabdQ99JY4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TrabdQ99JY4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TrabdQ99JY4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TrabdQ99JY4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TrabdQ99JY4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TrabdQ99JY4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TrabdQ99JY4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TrabdQ99JY4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TrabdQ99JY4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
TrabdQ99JY4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TrabdQ99JY4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TrabdQ99JY4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TrabdQ99JY4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TrabdQ99JY4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TrabdQ99JY4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TrabdQ99JY4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TrabdQ99JY4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TrabdQ99JY4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TrabdQ99JY4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TrabdQ99JY4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TrabdQ99JY4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TrabdQ99JY4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TrabdQ99JY4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TrabdQ99JY4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TrabdQ99JY4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TrabdQ99JY4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TrabdQ99JY4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TrabdQ99JY4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TrabdQ99JY4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TrabdQ99JY4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TrabdQ99JY4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TrabdQ99JY4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TrabdQ99JY4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TrabdQ99JY4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TrabdQ99JY4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TrabdQ99JY4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TrabdQ99JY4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TrabdQ99JY4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TrabdQ99JY4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TrabdQ99JY4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TrabdQ99JY4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TrabdQ99JY4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TrabdQ99JY4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TrabdQ99JY4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TrabdQ99JY4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TrabdQ99JY4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TrabdQ99JY4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TrabdQ99JY4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TrabdQ99JY4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TrabdQ99JY4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TrabdQ99JY4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TrabdQ99JY4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TrabdQ99JY4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TrabdQ99JY4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TrabdQ99JY4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TrabdQ99JY4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TrabdQ99JY4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TrabdQ99JY4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TrabdQ99JY4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TrabdQ99JY4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TrabdQ99JY4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TrabdQ99JY4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TrabdQ99JY4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TrabdQ99JY4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TrabdQ99JY4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TrabdQ99JY4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TrabdQ99JY4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TrabdQ99JY4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TrabdQ99JY4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TrabdQ99JY4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TrabdQ99JY4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TrabdQ99JY4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TrabdQ99JY4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TrabdQ99JY4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TrabdQ99JY4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TrabdQ99JY4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TrabdQ99JY4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TrabdQ99JY4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TrabdQ99JY4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TrabdQ99JY4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TrabdQ99JY4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TrabdQ99JY4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TrabdQ99JY4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TrabdQ99JY4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TrabdQ99JY4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TrabdQ99JY4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms