Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lims1Q99JW4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lims1Q99JW4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lims1Q99JW4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lims1Q99JW4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lims1Q99JW4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lims1Q99JW4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lims1Q99JW4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lims1Q99JW4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lims1Q99JW4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lims1Q99JW4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lims1Q99JW4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lims1Q99JW4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lims1Q99JW4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lims1Q99JW4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lims1Q99JW4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Lims1Q99JW4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lims1Q99JW4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lims1Q99JW4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lims1Q99JW4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lims1Q99JW4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lims1Q99JW4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Lims1Q99JW4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lims1Q99JW4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lims1Q99JW4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lims1Q99JW4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lims1Q99JW4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lims1Q99JW4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lims1Q99JW4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lims1Q99JW4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lims1Q99JW4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lims1Q99JW4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lims1Q99JW4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lims1Q99JW4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lims1Q99JW4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lims1Q99JW4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lims1Q99JW4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lims1Q99JW4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lims1Q99JW4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Lims1Q99JW4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lims1Q99JW4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lims1Q99JW4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lims1Q99JW4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lims1Q99JW4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lims1Q99JW4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lims1Q99JW4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lims1Q99JW4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lims1Q99JW4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lims1Q99JW4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lims1Q99JW4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lims1Q99JW4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lims1Q99JW4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lims1Q99JW4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lims1Q99JW4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lims1Q99JW4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lims1Q99JW4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lims1Q99JW4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lims1Q99JW4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lims1Q99JW4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lims1Q99JW4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lims1Q99JW4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lims1Q99JW4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lims1Q99JW4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lims1Q99JW4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Lims1Q99JW4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lims1Q99JW4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lims1Q99JW4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lims1Q99JW4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lims1Q99JW4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lims1Q99JW4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lims1Q99JW4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lims1Q99JW4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lims1Q99JW4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lims1Q99JW4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lims1Q99JW4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lims1Q99JW4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lims1Q99JW4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lims1Q99JW4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Lims1Q99JW4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lims1Q99JW4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lims1Q99JW4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lims1Q99JW4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lims1Q99JW4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lims1Q99JW4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lims1Q99JW4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lims1Q99JW4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lims1Q99JW4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Lims1Q99JW4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lims1Q99JW4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lims1Q99JW4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lims1Q99JW4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lims1Q99JW4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lims1Q99JW4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lims1Q99JW4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lims1Q99JW4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lims1Q99JW4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lims1Q99JW4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lims1Q99JW4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lims1Q99JW4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lims1Q99JW4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms