Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT6

Tlcd1, Calfacilitin, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlcd1Q99JT6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tlcd1Q99JT6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tlcd1Q99JT6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tlcd1Q99JT6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tlcd1Q99JT6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tlcd1Q99JT6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tlcd1Q99JT6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tlcd1Q99JT6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tlcd1Q99JT6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tlcd1Q99JT6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tlcd1Q99JT6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tlcd1Q99JT6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tlcd1Q99JT6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tlcd1Q99JT6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tlcd1Q99JT6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tlcd1Q99JT6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tlcd1Q99JT6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tlcd1Q99JT6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tlcd1Q99JT6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tlcd1Q99JT6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tlcd1Q99JT6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tlcd1Q99JT6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tlcd1Q99JT6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tlcd1Q99JT6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tlcd1Q99JT6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tlcd1Q99JT6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tlcd1Q99JT6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tlcd1Q99JT6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tlcd1Q99JT6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tlcd1Q99JT6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tlcd1Q99JT6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tlcd1Q99JT6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Tlcd1Q99JT6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tlcd1Q99JT6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tlcd1Q99JT6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tlcd1Q99JT6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tlcd1Q99JT6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tlcd1Q99JT6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tlcd1Q99JT6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tlcd1Q99JT6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tlcd1Q99JT6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tlcd1Q99JT6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tlcd1Q99JT6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tlcd1Q99JT6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tlcd1Q99JT6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tlcd1Q99JT6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tlcd1Q99JT6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tlcd1Q99JT6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tlcd1Q99JT6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tlcd1Q99JT6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tlcd1Q99JT6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tlcd1Q99JT6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tlcd1Q99JT6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tlcd1Q99JT6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Tlcd1Q99JT6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tlcd1Q99JT6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Tlcd1Q99JT6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tlcd1Q99JT6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tlcd1Q99JT6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tlcd1Q99JT6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tlcd1Q99JT6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tlcd1Q99JT6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tlcd1Q99JT6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tlcd1Q99JT6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tlcd1Q99JT6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tlcd1Q99JT6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tlcd1Q99JT6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tlcd1Q99JT6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tlcd1Q99JT6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tlcd1Q99JT6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tlcd1Q99JT6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tlcd1Q99JT6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tlcd1Q99JT6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tlcd1Q99JT6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tlcd1Q99JT6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tlcd1Q99JT6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tlcd1Q99JT6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tlcd1Q99JT6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tlcd1Q99JT6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tlcd1Q99JT6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tlcd1Q99JT6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tlcd1Q99JT6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tlcd1Q99JT6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tlcd1Q99JT6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tlcd1Q99JT6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tlcd1Q99JT6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tlcd1Q99JT6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tlcd1Q99JT6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tlcd1Q99JT6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tlcd1Q99JT6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tlcd1Q99JT6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tlcd1Q99JT6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tlcd1Q99JT6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tlcd1Q99JT6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tlcd1Q99JT6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tlcd1Q99JT6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tlcd1Q99JT6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tlcd1Q99JT6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tlcd1Q99JT6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Tlcd1Q99JT6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms