Protein–RNA interactions for Protein: Q99JH8

Kdelr1, ER lumen protein-retaining receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdelr1Q99JH8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Kdelr1Q99JH8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kdelr1Q99JH8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kdelr1Q99JH8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Kdelr1Q99JH8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kdelr1Q99JH8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kdelr1Q99JH8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Kdelr1Q99JH8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kdelr1Q99JH8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kdelr1Q99JH8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kdelr1Q99JH8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kdelr1Q99JH8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kdelr1Q99JH8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kdelr1Q99JH8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kdelr1Q99JH8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kdelr1Q99JH8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kdelr1Q99JH8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kdelr1Q99JH8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kdelr1Q99JH8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kdelr1Q99JH8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kdelr1Q99JH8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kdelr1Q99JH8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kdelr1Q99JH8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kdelr1Q99JH8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kdelr1Q99JH8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kdelr1Q99JH8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kdelr1Q99JH8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kdelr1Q99JH8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kdelr1Q99JH8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kdelr1Q99JH8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kdelr1Q99JH8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kdelr1Q99JH8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kdelr1Q99JH8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kdelr1Q99JH8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdelr1Q99JH8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdelr1Q99JH8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdelr1Q99JH8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdelr1Q99JH8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdelr1Q99JH8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdelr1Q99JH8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdelr1Q99JH8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kdelr1Q99JH8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kdelr1Q99JH8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kdelr1Q99JH8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kdelr1Q99JH8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kdelr1Q99JH8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kdelr1Q99JH8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kdelr1Q99JH8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kdelr1Q99JH8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kdelr1Q99JH8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kdelr1Q99JH8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kdelr1Q99JH8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kdelr1Q99JH8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kdelr1Q99JH8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kdelr1Q99JH8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kdelr1Q99JH8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kdelr1Q99JH8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kdelr1Q99JH8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kdelr1Q99JH8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Kdelr1Q99JH8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kdelr1Q99JH8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Kdelr1Q99JH8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kdelr1Q99JH8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kdelr1Q99JH8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kdelr1Q99JH8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kdelr1Q99JH8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kdelr1Q99JH8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kdelr1Q99JH8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kdelr1Q99JH8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kdelr1Q99JH8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kdelr1Q99JH8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kdelr1Q99JH8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Kdelr1Q99JH8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kdelr1Q99JH8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kdelr1Q99JH8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kdelr1Q99JH8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kdelr1Q99JH8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kdelr1Q99JH8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kdelr1Q99JH8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kdelr1Q99JH8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kdelr1Q99JH8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kdelr1Q99JH8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kdelr1Q99JH8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kdelr1Q99JH8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kdelr1Q99JH8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kdelr1Q99JH8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kdelr1Q99JH8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kdelr1Q99JH8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kdelr1Q99JH8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kdelr1Q99JH8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kdelr1Q99JH8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kdelr1Q99JH8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kdelr1Q99JH8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kdelr1Q99JH8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kdelr1Q99JH8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Kdelr1Q99JH8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kdelr1Q99JH8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kdelr1Q99JH8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kdelr1Q99JH8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kdelr1Q99JH8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms