Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pacsin3Q99JB8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pacsin3Q99JB8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pacsin3Q99JB8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pacsin3Q99JB8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pacsin3Q99JB8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pacsin3Q99JB8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pacsin3Q99JB8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pacsin3Q99JB8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pacsin3Q99JB8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pacsin3Q99JB8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pacsin3Q99JB8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pacsin3Q99JB8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pacsin3Q99JB8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pacsin3Q99JB8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pacsin3Q99JB8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pacsin3Q99JB8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pacsin3Q99JB8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pacsin3Q99JB8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pacsin3Q99JB8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pacsin3Q99JB8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pacsin3Q99JB8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pacsin3Q99JB8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pacsin3Q99JB8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pacsin3Q99JB8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pacsin3Q99JB8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pacsin3Q99JB8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pacsin3Q99JB8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pacsin3Q99JB8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pacsin3Q99JB8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pacsin3Q99JB8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pacsin3Q99JB8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pacsin3Q99JB8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pacsin3Q99JB8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Pacsin3Q99JB8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pacsin3Q99JB8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pacsin3Q99JB8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pacsin3Q99JB8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pacsin3Q99JB8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pacsin3Q99JB8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pacsin3Q99JB8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pacsin3Q99JB8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pacsin3Q99JB8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pacsin3Q99JB8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pacsin3Q99JB8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pacsin3Q99JB8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pacsin3Q99JB8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pacsin3Q99JB8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pacsin3Q99JB8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pacsin3Q99JB8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pacsin3Q99JB8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pacsin3Q99JB8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pacsin3Q99JB8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pacsin3Q99JB8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pacsin3Q99JB8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pacsin3Q99JB8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pacsin3Q99JB8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pacsin3Q99JB8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pacsin3Q99JB8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pacsin3Q99JB8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pacsin3Q99JB8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pacsin3Q99JB8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pacsin3Q99JB8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Pacsin3Q99JB8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pacsin3Q99JB8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pacsin3Q99JB8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pacsin3Q99JB8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pacsin3Q99JB8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pacsin3Q99JB8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pacsin3Q99JB8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pacsin3Q99JB8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pacsin3Q99JB8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pacsin3Q99JB8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pacsin3Q99JB8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pacsin3Q99JB8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pacsin3Q99JB8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pacsin3Q99JB8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pacsin3Q99JB8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pacsin3Q99JB8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pacsin3Q99JB8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pacsin3Q99JB8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pacsin3Q99JB8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pacsin3Q99JB8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pacsin3Q99JB8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pacsin3Q99JB8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pacsin3Q99JB8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pacsin3Q99JB8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pacsin3Q99JB8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Pacsin3Q99JB8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pacsin3Q99JB8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pacsin3Q99JB8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pacsin3Q99JB8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pacsin3Q99JB8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pacsin3Q99JB8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pacsin3Q99JB8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pacsin3Q99JB8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pacsin3Q99JB8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pacsin3Q99JB8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pacsin3Q99JB8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pacsin3Q99JB8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.1 ms