Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddb2Q99J79 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddb2Q99J79 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddb2Q99J79 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddb2Q99J79 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddb2Q99J79 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddb2Q99J79 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddb2Q99J79 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddb2Q99J79 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddb2Q99J79 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddb2Q99J79 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddb2Q99J79 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddb2Q99J79 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddb2Q99J79 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddb2Q99J79 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddb2Q99J79 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddb2Q99J79 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddb2Q99J79 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddb2Q99J79 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddb2Q99J79 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddb2Q99J79 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddb2Q99J79 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddb2Q99J79 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddb2Q99J79 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddb2Q99J79 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddb2Q99J79 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddb2Q99J79 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddb2Q99J79 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddb2Q99J79 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddb2Q99J79 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddb2Q99J79 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddb2Q99J79 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddb2Q99J79 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddb2Q99J79 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddb2Q99J79 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddb2Q99J79 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddb2Q99J79 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddb2Q99J79 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddb2Q99J79 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddb2Q99J79 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddb2Q99J79 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddb2Q99J79 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddb2Q99J79 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddb2Q99J79 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddb2Q99J79 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddb2Q99J79 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddb2Q99J79 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddb2Q99J79 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddb2Q99J79 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddb2Q99J79 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddb2Q99J79 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddb2Q99J79 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddb2Q99J79 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddb2Q99J79 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddb2Q99J79 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddb2Q99J79 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddb2Q99J79 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddb2Q99J79 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddb2Q99J79 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddb2Q99J79 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddb2Q99J79 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddb2Q99J79 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddb2Q99J79 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddb2Q99J79 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddb2Q99J79 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddb2Q99J79 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddb2Q99J79 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddb2Q99J79 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddb2Q99J79 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddb2Q99J79 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddb2Q99J79 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ddb2Q99J79 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddb2Q99J79 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddb2Q99J79 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddb2Q99J79 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddb2Q99J79 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddb2Q99J79 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddb2Q99J79 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddb2Q99J79 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddb2Q99J79 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddb2Q99J79 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddb2Q99J79 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddb2Q99J79 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddb2Q99J79 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddb2Q99J79 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddb2Q99J79 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddb2Q99J79 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddb2Q99J79 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddb2Q99J79 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddb2Q99J79 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddb2Q99J79 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddb2Q99J79 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddb2Q99J79 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddb2Q99J79 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddb2Q99J79 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddb2Q99J79 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddb2Q99J79 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddb2Q99J79 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddb2Q99J79 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddb2Q99J79 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms