Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apobec3Q99J72 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apobec3Q99J72 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apobec3Q99J72 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apobec3Q99J72 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apobec3Q99J72 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apobec3Q99J72 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apobec3Q99J72 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apobec3Q99J72 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apobec3Q99J72 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apobec3Q99J72 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apobec3Q99J72 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apobec3Q99J72 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apobec3Q99J72 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apobec3Q99J72 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apobec3Q99J72 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Apobec3Q99J72 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apobec3Q99J72 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apobec3Q99J72 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apobec3Q99J72 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apobec3Q99J72 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apobec3Q99J72 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apobec3Q99J72 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Apobec3Q99J72 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Apobec3Q99J72 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Apobec3Q99J72 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Apobec3Q99J72 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Apobec3Q99J72 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Apobec3Q99J72 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Apobec3Q99J72 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Apobec3Q99J72 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Apobec3Q99J72 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Apobec3Q99J72 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Apobec3Q99J72 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Apobec3Q99J72 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Apobec3Q99J72 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Apobec3Q99J72 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Apobec3Q99J72 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apobec3Q99J72 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apobec3Q99J72 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apobec3Q99J72 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apobec3Q99J72 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apobec3Q99J72 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apobec3Q99J72 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apobec3Q99J72 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apobec3Q99J72 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apobec3Q99J72 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apobec3Q99J72 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apobec3Q99J72 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Apobec3Q99J72 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Apobec3Q99J72 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apobec3Q99J72 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apobec3Q99J72 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apobec3Q99J72 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apobec3Q99J72 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apobec3Q99J72 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apobec3Q99J72 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Apobec3Q99J72 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Apobec3Q99J72 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Apobec3Q99J72 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Apobec3Q99J72 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Apobec3Q99J72 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Apobec3Q99J72 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Apobec3Q99J72 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Apobec3Q99J72 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Apobec3Q99J72 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Apobec3Q99J72 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Apobec3Q99J72 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Apobec3Q99J72 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Apobec3Q99J72 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Apobec3Q99J72 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Apobec3Q99J72 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Apobec3Q99J72 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Apobec3Q99J72 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Apobec3Q99J72 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Apobec3Q99J72 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Apobec3Q99J72 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Apobec3Q99J72 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Apobec3Q99J72 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Apobec3Q99J72 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Apobec3Q99J72 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Apobec3Q99J72 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Apobec3Q99J72 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Apobec3Q99J72 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Apobec3Q99J72 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Apobec3Q99J72 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Apobec3Q99J72 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Apobec3Q99J72 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apobec3Q99J72 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apobec3Q99J72 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apobec3Q99J72 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apobec3Q99J72 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apobec3Q99J72 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apobec3Q99J72 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apobec3Q99J72 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apobec3Q99J72 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apobec3Q99J72 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apobec3Q99J72 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apobec3Q99J72 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apobec3Q99J72 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms