Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctu1Q99J10 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctu1Q99J10 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctu1Q99J10 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctu1Q99J10 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctu1Q99J10 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctu1Q99J10 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctu1Q99J10 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctu1Q99J10 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctu1Q99J10 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctu1Q99J10 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctu1Q99J10 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctu1Q99J10 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctu1Q99J10 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctu1Q99J10 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctu1Q99J10 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctu1Q99J10 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctu1Q99J10 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctu1Q99J10 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctu1Q99J10 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctu1Q99J10 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctu1Q99J10 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctu1Q99J10 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctu1Q99J10 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctu1Q99J10 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctu1Q99J10 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctu1Q99J10 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctu1Q99J10 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctu1Q99J10 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctu1Q99J10 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctu1Q99J10 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctu1Q99J10 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctu1Q99J10 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctu1Q99J10 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctu1Q99J10 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctu1Q99J10 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctu1Q99J10 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctu1Q99J10 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctu1Q99J10 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctu1Q99J10 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctu1Q99J10 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctu1Q99J10 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctu1Q99J10 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctu1Q99J10 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctu1Q99J10 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctu1Q99J10 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctu1Q99J10 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctu1Q99J10 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctu1Q99J10 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctu1Q99J10 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctu1Q99J10 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctu1Q99J10 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctu1Q99J10 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctu1Q99J10 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctu1Q99J10 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctu1Q99J10 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctu1Q99J10 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctu1Q99J10 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctu1Q99J10 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctu1Q99J10 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctu1Q99J10 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctu1Q99J10 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctu1Q99J10 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctu1Q99J10 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctu1Q99J10 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctu1Q99J10 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctu1Q99J10 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctu1Q99J10 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctu1Q99J10 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctu1Q99J10 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctu1Q99J10 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctu1Q99J10 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Ctu1Q99J10 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ctu1Q99J10 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ctu1Q99J10 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ctu1Q99J10 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Ctu1Q99J10 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctu1Q99J10 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctu1Q99J10 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctu1Q99J10 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctu1Q99J10 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctu1Q99J10 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctu1Q99J10 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctu1Q99J10 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctu1Q99J10 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctu1Q99J10 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctu1Q99J10 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctu1Q99J10 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctu1Q99J10 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctu1Q99J10 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctu1Q99J10 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctu1Q99J10 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctu1Q99J10 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctu1Q99J10 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctu1Q99J10 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctu1Q99J10 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctu1Q99J10 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctu1Q99J10 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctu1Q99J10 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctu1Q99J10 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.8 ms