Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn16Q925N4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn16Q925N4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn16Q925N4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn16Q925N4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn16Q925N4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn16Q925N4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn16Q925N4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn16Q925N4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn16Q925N4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn16Q925N4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn16Q925N4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn16Q925N4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn16Q925N4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn16Q925N4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn16Q925N4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn16Q925N4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn16Q925N4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn16Q925N4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn16Q925N4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn16Q925N4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn16Q925N4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn16Q925N4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn16Q925N4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn16Q925N4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn16Q925N4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn16Q925N4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn16Q925N4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn16Q925N4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn16Q925N4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn16Q925N4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn16Q925N4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn16Q925N4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn16Q925N4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn16Q925N4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn16Q925N4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn16Q925N4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn16Q925N4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn16Q925N4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn16Q925N4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn16Q925N4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn16Q925N4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn16Q925N4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn16Q925N4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn16Q925N4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn16Q925N4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn16Q925N4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn16Q925N4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn16Q925N4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn16Q925N4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn16Q925N4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn16Q925N4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn16Q925N4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn16Q925N4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn16Q925N4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn16Q925N4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn16Q925N4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn16Q925N4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn16Q925N4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn16Q925N4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn16Q925N4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn16Q925N4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn16Q925N4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn16Q925N4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn16Q925N4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn16Q925N4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn16Q925N4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn16Q925N4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn16Q925N4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn16Q925N4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn16Q925N4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn16Q925N4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn16Q925N4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn16Q925N4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn16Q925N4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn16Q925N4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn16Q925N4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn16Q925N4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn16Q925N4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn16Q925N4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn16Q925N4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn16Q925N4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn16Q925N4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn16Q925N4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn16Q925N4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn16Q925N4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn16Q925N4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn16Q925N4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn16Q925N4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn16Q925N4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn16Q925N4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn16Q925N4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn16Q925N4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn16Q925N4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn16Q925N4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn16Q925N4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn16Q925N4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn16Q925N4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn16Q925N4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn16Q925N4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms